レコード詳細
oRNAment: o RNA motifs enrichment in complete transcriptomes
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC02581 | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| 名称データベースの名称 | oRNAment | ||||
| 別称データベースの別称 | o RNA motifs enrichment in complete transcriptomes | ||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | https://rnabiology.ircm.qc.ca/oRNAment | ||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | Lécuyer Lab, Institut de Recherches Cliniques de Montéral | ||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | カナダ | ||||
| 説明データベースの説明 | ヒトやマウスなど5種類の生物のRNA結合タンパク質の推定結合ドメインのデータベースです。各RNA結合タンパク質について、生物種、コードする遺伝子名、モチーフ名、モチーフのゲノム上の位置情報、種特異性の有無、標準モチーフとの配列類似性スコアなどのデータが収録されています。データは、生物種、RNA結合タンパク質名、遺伝子やmRNAの性質、配列の存在領域から検索可能で、検索結果およびすべてのデータをダウンロードすることができます。 | ||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Homo sapiens (9606), Caenorhabditis elegans (6239), Danio rerio (7955), Drosophila melanogaster (7227), Mus musculus (10090) | ||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
|
||||
| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
|
||||
| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
|
||||
| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 | ||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | https://rnabiology.ircm.qc.ca/oRNAment/downloads/ | ||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | https://rnabiology.ircm.qc.ca/oRNAment/downloads/ | ||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||
| データベースの使い方 | https://rnabiology.ircm.qc.ca/oRNAment/tutorial/ | ||||
| データベースの連絡先 | https://rnabiology.ircm.qc.ca/oRNAment/tutorial/ | ||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | ― | ||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog | ||||
| レコードの由来レコードの由来 |
|
||||
| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2021-08-24 | ||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2024-05-15 | ||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |