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dbAMP

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02467
名称データベースの名称 dbAMP
別称データベースの別称 ―
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://140.138.77.240/~dbamp/index.php
運用機関名現在データベースを運用している機関名 Arieh Warshel Institute of Computational Biology, The Chinese University of Hong Kong
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 中国
説明データベースの説明 抗菌ペプチド（Antimicrobial peptides: AMP）のデータベースです。AMPについて配列、取得生物種、ターゲットとなる種などの基本情報、抗菌活性、物理化学的特性、相互作用タンパク質、構造、外部リンクが収録されています。公開された文献または公開データベースから抽出された実験的背景をもつAMPと、公開データベースから得られた予測AMPの2種類のデータを含んでいます。ペプチド、生物、構造、ターゲット、文献からブラウズできます。また、活性のタイプ、ペプチド長、生物種による絞り込みが可能です。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Archaea (2157), Bacteria (2), Fungi (4751), Embryophyta (3193), Homo sapiens (9606), Hexapoda (6960), Amphibia (8292), Arthropoda (6656), Vertebrata (7742), Mollusca (6447), Eukaryota (2759), Viruses (10239)
タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:30380085
DOI:10.1093/nar/gky1030
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 休止
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク http://140.138.77.240/~dbamp/download.php
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 http://140.138.77.240/~dbamp/download.php
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 http://140.138.77.240/~dbamp/download/LICENSE
データベースの使い方 http://140.138.77.240/~dbamp/tutorial.php
データベースの連絡先 http://140.138.77.240/~dbamp/index.php
API / SPARQL endpoint ―
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク ―
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク ―
統合TVへのリンク統合TVへのリンク ―
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク ―
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2019-10-09
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2020-10-04
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license