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Pocketome: an encyclopedia of small-molecule binding sites in 4D: Pocketome
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC02078 | ||||||||
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| 名称データベースの名称 | Pocketome: an encyclopedia of small-molecule binding sites in 4D | ||||||||
| 別称データベースの別称 | Pocketome | ||||||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://pocketome.org | ||||||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | The Abagyan Lab UC San Diego, University of California San Diego | ||||||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | アメリカ合衆国 | ||||||||
| 説明データベースの説明 | 低分子化合物により機能調節ができる可能性が高い結合部位（druggable binding site）の立体構造的な組み合わせに関する百科事典です。立体構造は、Protein Data Bank に収載された共結晶構造から、実験的に特定することができます。各エントリーは、低分子およびペプチドとの一時的な相互作用に関与するタンパク質表面上の部位を表わし、結合サイトの構造、ポケットの位置、結合部位の位置、ポケットとリガンドの立体的互換性やタンパク質の３次元表示を含んでいます。 | ||||||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | All (1) | ||||||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 休止 | ||||||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― | ||||||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― | ||||||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||||||
| データベースの使い方 | ― | ||||||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.tc6df8 | ||||||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||||||
| レコード管理者レコード管理者 | See the corresponding part in the FAIRsharing record | ||||||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2019-03-28 | ||||||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2020-07-09 | ||||||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |