レコード詳細
Planteome
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC02302 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 名称データベースの名称 | Planteome | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 別称データベースの別称 | ― | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://www.planteome.org | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | Oregon State University, Bioversity International, New York Botanical Garden, Lawrence Berkeley National Laboratory | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | アメリカ合衆国 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 説明データベースの説明 | 植物のリファレンスオントロジーと遺伝子、表現型のデータを統合したデータベースです。Planteomeプロジェクトの開発した植物オントロジー（PO）、植物形質オントロジー（TO）、植物実験条件オントロジー（PECO）のほか、Gene Ontologyなどの外部オントロジーと、生物実体（遺伝子、タンパク質、遺伝資源など）へのアノテーション情報が含まれます。オントロジー用語および生物実体の検索および、オントロジーツリー表示からの生物実体の絞り込み表示が出来ます。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Rhodophyta (2763), Phaeophyceae (2870), Chlorophyta (3041), Arabidopsis thaliana (3702), Bryophyta (3208), Cycadophyta (58020), Dicotyledones (71240), Fabaceae (3803), (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=), Gnetophyta (58022), Lycopodiopsida (1521260), Monocotyledons (4447), Oryza (4527), (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=), Polypodiopsida (241806), Solanaceae (4070), Viridiplantae (33090) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| データベースの使い方 | ― | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.k0kcjw | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| レコード管理者レコード管理者 | See the corresponding part in the FAIRsharing record | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2019-03-28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2020-07-09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |