レコード詳細
Proteome-pI : proteome isoelectric point database: Proteome-pI
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC02184 | ||||
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| 名称データベースの名称 | Proteome-pI : proteome isoelectric point database | ||||
| 別称データベースの別称 | Proteome-pI | ||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://isoelectricpointdb.org/ | ||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | Quantitative and Computational Biology Group, Max Planck Institute for Biophysical Chemistry | ||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | ドイツ, ポーランド | ||||
| 説明データベースの説明 | 予測計算されたプロテオームにおける等電点のデータベースです。18 種類の手法を用いて計算された 5,029 件のタンパク質（2,100万の配列）の予測される等電点についてアミノ酸配列、分子量、各手法により計算された等電点の情報を収録しています。生物名や平均等電点、分子量、仮想 2D-PAGE プロット、またはアミノ酸周波数により検索･閲覧することができます。極端な pI 値を有するタンパク質も利用可能です。個々のプロテオームについて、ユーザーは、所定の手法、等電点、および分子量の範囲から求めるタンパク質を検索することができます。一般的な統計情報（タンパク質の総数、アミノ酸、平均配列長、アミノ酸およびジアミノ酸の周波数）およびUniProtKB/TrEMBL や NCBI non-redundant (nr) database などといった主要なタンパク質データベースに対応するデータセットも、あらかじめ計算されています。 | ||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | All (1) | ||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 | ||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― | ||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― | ||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||
| データベースの使い方 | ― | ||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.yxkdpg | ||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||
| レコード管理者レコード管理者 | See the corresponding part in the FAIRsharing record | ||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2019-03-28 | ||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2020-07-09 | ||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |