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MODOMICS

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02129
名称データベースの名称 MODOMICS
別称データベースの別称
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://modomics.genesilico.pl/
運用機関名現在データベースを運用している機関名 Bujnicki Lab, Laboratory of Bioinformatics and Protein Engineering, International Institute of Molecular and Cell Biology in Warsaw (IIMCB)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 ポーランド
説明データベースの説明 RNA修飾に関する包括的なデータベースです。修飾されたヌクレオシドの化学構造、RNA配列におけるそれらの局在、それらの生合成のパスウェイ、およびタンパク質補因子と共同でそれぞれの反応を起こす酵素についての情報を収録しています。また、他のデータベースへのリンクも掲載しており、これらからまたこの他、タンパク質配列、構造データ(利用可能な場合)、学術論文から選別された参考文献情報、および生合成に関与する個々の修飾残基・タンパク質に関する包括的な情報を得ることが可能です。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Aquifex aeolicus (63363), Arabidopsis thaliana (3702), Archaeoglobus fulgidus (2234), Bacillus subtilis (1423), Chlorobium tepidum (1097), Clostridium thermocellum (1515), Enterococcus faecium (1352), Escherichia coli (562), Geobacillus kaustophilus (1462), Geobacter sulfurreducens (35554), Giardia (5740), Haemophilus influenzae (727), Haloferax volcanii (2246), Homo sapiens (9606), Methanocaldococcus jannaschii (2190), Methanopyrus kandleri (2320), Micromonospora zionensis (1879), Mus musculus (10090), Mycobacterium tuberculosis (1773), Mycoplasma capricolum (2095), Nostoc (1177), Pyrococcus abyssi (29292), Pyrococcus furiosus (2261), Pyrococcus horikoshii (53953), Saccharomyces cerevisiae (4932), Salmonella typhimurium (90371), Schizosaccharomyces pombe (4896), Staphylococcus sciuri (1296), Streptococcus pneumoniae (1313), Streptomyces actuosus (1885), Streptomyces cyaneus (1904), Streptomyces fradiae (1906), Streptomyces sp. DSM 40477 (1933), Streptomyces viridochromogenes (1938), Sulfolobus acidocaldarius (2285), Sulfolobus solfataricus (2287), Thermotoga maritima (2336), Thermus thermophilus (274), Trypanosoma brucei (5691), Yersinia pestis (632), Zymomonas mobilis (542)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:16381833
DOI:-
PubMed ID:18854352
DOI:-
PubMed ID:23118484
DOI:-
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件
データベースの使い方
データベースの連絡先
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.3qh2tg
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 See the corresponding part in the FAIRsharing record
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2019-03-28
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2020-07-09
本レコードの利用条件 Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license