レコード詳細
PTMcode
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC02120 | ||||||||||||
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| 名称データベースの名称 | PTMcode | ||||||||||||
| 別称データベースの別称 | ― | ||||||||||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://ptmcode.embl.de | ||||||||||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | |||||||||||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | ドイツ | ||||||||||||
| 説明データベースの説明 | 相互作用タンパク質内および相互作用タンパク質間のタンパク質翻訳後修飾（PTM）の機能的関連について、既知および予測のデータを集めたリソースです。（1）同様の進化歴を有するPTMの対を抽出する「共同進化」チャネル、（2）3D構造の近くに修飾された残基を報告する「構造的距離」チャネル、（3）いくつかのPTMタイプによって修飾された残基を強調する「競合」チャネル、（4）文献に記載された関連PTM対を提供する「手動アノテーション」チャネル。 （5）高密度修飾タンパク質領域を計算する「ホットスポット」チャネルの情報を収集しています。 | ||||||||||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Aedes aegypti (7159), Anopheles gambiae (7165), Arabidopsis thaliana (3702), Bos taurus (9913), Caenorhabditis elegans (6239), Canis familiaris (9615), Drosophila melanogaster (7227), Felis catus (9685), Gallus gallus (9031), Homo sapiens (9606), Macaca mulatta (9544), Monodelphis domestica (13616), Mus musculus (10090), Pan troglodytes (9598), Rattus norvegicus (10116), Saccharomyces cerevisiae (4932), Schizosaccharomyces pombe (4896), Xenopus tropicalis (8364) | ||||||||||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||||||||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 | ||||||||||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― | ||||||||||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― | ||||||||||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||||||||||
| データベースの使い方 | ― | ||||||||||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||||||||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||||||||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||||||||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||||||||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||||||||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.96xqbf | ||||||||||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||||||||||
| レコード管理者レコード管理者 | See the corresponding part in the FAIRsharing record | ||||||||||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2019-03-28 | ||||||||||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2020-07-09 | ||||||||||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |