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レコード詳細

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HaploReg

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02051
名称データベースの名称 HaploReg
別称データベースの別称 ―
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://compbio.mit.edu/HaploReg
運用機関名現在データベースを運用している機関名
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 アメリカ合衆国
説明データベースの説明 ハプロタイプブロックのバリアントにおけるノンコーディングゲノム（疾患に関連する遺伝子座における調節 SNP 候補など）についてのアノテーションを探索するツールです。1000 ゲノムプロジェクトから得られたLD（linkage disequilibrium：連鎖不均衡）やGWASの情報を利用することで、連鎖する SNP および小規模な挿入･欠失を可視化します。あわせて、Roadmap Epigenomics および ENCODE プロジェクトから得られた染色質の状態およびタンパク結合に関するアノテーション、哺乳類の配列保存、調節モチーフに対するSNPの影響、およびQTL研究から得られた発現に対する SNP の影響も掲載しています。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Homo sapiens (9606)
タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:26657631
DOI:-
PubMed ID:22064851
DOI:-
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク ―
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 ―
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 ―
データベースの使い方 ―
データベースの連絡先 ―
API / SPARQL endpoint ―
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク ―
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク ―
統合TVへのリンク統合TVへのリンク ―
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.x18jh7
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 See the corresponding part in the FAIRsharing record
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2019-03-28
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2020-07-09
本レコードの利用条件 Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license