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Biological General Repository for Interaction Datasets: BioGRID

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC01857
名称データベースの名称 Biological General Repository for Interaction Datasets
別称データベースの別称 BioGRID
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://www.thebiogrid.org
運用機関名現在データベースを運用している機関名 Princeton University, Samuel Lunenfeld Research Institute, Mount Sinai Hospital, University of Edinburgh, University of Montreal
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 カナダ, アメリカ合衆国
説明データベースの説明 生物学的な相互作用のリポジトリです。タンパク質や遺伝子の相互作用、化学結合、翻訳後修飾について主要な公開文献から得られたハイスループットのデータセットと焦点を絞った個別の研究からキュレーションした生物種、実験手法、文献などのデータを、作用因子、相互作用、ネットワーク、PTM部位に分けて表示します。主要なモデル生物をカバーしています。すべてのデータは、生物種による絞り込みやキーワード、遺伝子名、文献などによる検索が可能であり、標準化された形式でダウンロードすることができます。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Arabidopsis thaliana (3702), Bos taurus (9913), Caenorhabditis elegans (6239), Candida albicans (5476), Drosophila melanogaster (7227), Escherichia coli K-12 (83333), Gallus gallus (9031), Hepatitis C virus (3052230), Homo sapiens (9606), Human immunodeficiency virus (12721), Mus musculus (10090), Plasmodium falciparum (5833), Rattus norvegicus (10116), Saccharomyces cerevisiae (4932), Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2697049), Schizosaccharomyces pombe (4896), Xenopus laevis (8355)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:16381927
DOI:-
PubMed ID:12620108
DOI:-
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件
データベースの使い方
データベースの連絡先
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.9d5f5r
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 See the corresponding part in the FAIRsharing record
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2019-03-28
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2024-07-24
本レコードの利用条件 Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license