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DIP: Database of Interacting Proteins

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC00049
名称データベースの名称 DIP
別称データベースの別称 Database of Interacting Proteins
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://dip.doe-mbi.ucla.edu/dip/Main.cgi
運用機関名現在データベースを運用している機関名 University of California
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 アメリカ合衆国
説明データベースの説明 Yeast two-hybrid等の生化学実験によって決定されたタンパク質間相互作用のデータベースです。相互作用するタンパク質の情報の他に、相互作用マップを提供しています。相互作用マップでは、相互作用の信頼度によりエッジが色分けされています。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Saccharomyces cerevisiae (4932), Drosophila melanogaster (7227), Escherichia coli (562), Caenorhabditis elegans (6239), Homo sapiens (9606), Helicobacter pylori (210), Mus musculus (10090), Rattus norvegicus (10116), Bos taurus (9913), Arabidopsis thaliana (3702)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:14681454
DOI:-
PubMed ID:1175232
DOI:-
PubMed ID:11125102
DOI:-
PubMed ID:10592249
DOI:-
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク http://dip.doe-mbi.ucla.edu/dip/Download.cgi
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 http://dip.doe-mbi.ucla.edu/dip/Guide.cgi?SM=0:24, http://dip.doe-mbi.ucla.edu/dip/Guide.cgi?SM=0:3, http://dip.doe-mbi.ucla.edu/dip/Guide.cgi?SM=0:4, http://psidev.sourceforge.net/molecular_interactions//xml/doc/user/
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 http://dip.doe-mbi.ucla.edu/dip/Main.cgi
データベースの使い方
データベースの連絡先
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク https://fairsharing.org/biodbcore-000558
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レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2011-12-08
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2022-05-29
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license