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J-phenome: A portal of phenotype data analyzed in Japan

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC01510
名称データベースの名称 J-phenome
別称データベースの別称 A portal of phenotype data analyzed in Japan
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://jphenome.info
運用機関名現在データベースを運用している機関名 国立研究開発法人理化学研究所 (J-Globalへのリンク)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 日本
説明データベースの説明 遺伝子の多様性の結果として現れる生物の表現型情報を集約したポータルサイトです。バイオサイエンスデータベースセンター(NBDC: 現 NBDC事業推進部)における統合化推進プログラムの採択課題「生命と環境のフェノーム統合データベース」の成果です。哺乳類、シロイヌナズナ、微生物など、幅広い研究コミュニティから収集した情報を、研究分野の垣根を超えて標準化・統合化・体系化し、オープンに公開しています。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Mammalia (40674), Bacteria (2), Arabidopsis thaliana (3702)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 日本語, 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件
データベースの使い方
データベースの連絡先
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
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レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2015-06-30
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2022-05-29
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license