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Genome sequencing of JCM strains under the NBRP program (Eukaryotic microbes)

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02639
名称データベースの名称 Genome sequencing of JCM strains under the NBRP program (Eukaryotic microbes)
別称データベースの別称
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://www.jcm.riken.jp/cgi-bin/nbrp/nbrp_list.cgi
運用機関名現在データベースを運用している機関名 特定国立研究開発法人理化学研究所 (J-Globalへのリンク)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 日本
説明データベースの説明 理化学研究所バイオリソース研究センター微生物材料開発室(JCM)が保有する一般真核微生物株のドラフトゲノム配列とリソース情報のデータベースです。NBRPプログラムによりライフサイエンス技術基盤研究センター機能性ゲノム解析部門と共同でゲノム解読した細菌、古細菌、真菌の学名、カタログID、BioProject IDの他、ゲノムアッセンブリーとアノテーションの概要、ドラフトゲノム配列、微生物株のリソース情報を収録しています。属名による絞り込みが可能で、種小名はアルファベット順に掲載されています。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Saccharomycotina (147537), Pezizomycotina (147538), Ustilaginomycotina (452284), Pucciniomycotina (29000), Agaricomycotina (5302), Mucoromycotina (451507), Chlorophyta (3041), Stramenopiles (33634)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 https://www.jcm.riken.jp/NBRP/terms_of_use/terms_of_use_jp.html
データベースの使い方
データベースの連絡先
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
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レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2024-03-22
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2024-03-22
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license