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運用終了

FUJI DB: タンパク質オンデマンド解析データベース (Functionally Annotated Japanese Protein Structural Information database)

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC01241
名称データベースの名称 FUJI DB
別称データベースの別称 タンパク質オンデマンド解析データベース (Functionally Annotated Japanese Protein Structural Information database)
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://www.tanpaku.org/fujidb/
運用機関名現在データベースを運用している機関名 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 (J-Globalへのリンク)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 日本
説明データベースの説明 指定された任意のタンパク質のアミノ酸配列に対し、様々な情報を付加して、機能予測を行うアミノ酸配列オンデマンド解析データベースです。配列の特徴分析、立体構造、天然変成 (disorder)領域の予測、さらに配列の類似性だけでなく立体構造情報も考慮しての機能予測を行い、表示します。本データベースは文部科学省ターゲットタンパク研究プログラムのプロジェクトの一環で開発されました。 国立遺伝学研究所による FUJI DB のオリジナルサイト(http ://www.tanpaku.org/fujidb/)の運用は終了しました。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 日本語, 英語
稼動状況データベースの稼動状況 運用終了
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件
データベースの使い方
データベースの連絡先
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
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レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2013-01-07
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2013-05-02
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license