レコード詳細
DASH: Database of Aligned Structural Homologs
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC01154 | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| 名称データベースの名称 | DASH | ||||
| 別称データベースの別称 | Database of Aligned Structural Homologs | ||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | https://sysimm.org/dash/ | ||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | 大阪大学 蛋白質研究所 (J-Globalへのリンク) | ||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | 日本 | ||||
| 説明データベースの説明 | PDBエントリに対し、似た構造のタンパク質ドメインやタンパク質鎖を検索するデータベースです。PDB IDで検索するとタンパク質鎖のIDや代表的なドメインのリストが表示されます。また、アミノ酸配列により検索すると、タンパク質鎖のID、一致する配列の長さと位置のリストで表示されます。各ドメインやタンパク質鎖のエントリにはドメインの説明、３次元構造、アミノ酸標準配列、ドメインのASHスコア、NERスコアなどを収録しています。 PDBj (http://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc00157) が提供するサービスの１つであり、Structure Navigator（http ://pdbj.org/strucnavi）の後継サイトです。 | ||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | ― | ||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
|
||||
| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
|
||||
| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
|
||||
| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 | ||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― | ||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― | ||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||
| データベースの使い方 | ― | ||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | ― | ||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog | ||||
| レコードの由来レコードの由来 |
|
||||
| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2012-06-25 | ||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2021-08-10 | ||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |