レコード詳細
イネタンパク質構造データベース（アーカイブ）: RPSD
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC00749 |
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| 名称データベースの名称 | イネタンパク質構造データベース（アーカイブ） |
| 別称データベースの別称 | RPSD |
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/rpsd/desc.html |
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | 国立研究開発法人科学技術振興機構 NBDC事業推進部 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | 日本 |
| 説明データベースの説明 | イネなど7種類の植物のタンパク質の立体構造を収集したデータベースです。Protein Data Bankを情報源とし、タンパク質の基本情報、構造決定に用いた実験手法、文献情報、配列、立体構造の画像等を掲載しています。 国立研究開発法人 農業生物資源研究所によるオリジナルサイト (http ://structure.rice.dna.affrc.go.jp/plant/index.html) の運用は終了しました。RPSDのデータは引き続き生命科学系データベースアーカイブからご利用いただけます。 |
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Oryza sativa (4530), Sorghum bicolor (4558), Zea mays (4577), Hordeum vulgare (4513), Triticum aestivum (4565), Arabidopsis thaliana (3702), Glycine max (3847) |
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI | ― |
| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 日本語, 英語 |
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/rpsd/download.html |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/rpsd/LATEST/README.html |
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/rpsd/lic.html |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先 | ― |
| API / SPARQL endpoint | ― |
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/rpsd/desc.html |
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― |
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― |
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | ― |
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog |
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2011-12-08 |
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2022-05-29 |
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |