レコード詳細
運用終了
RIKEN Arabidopsis cDNA Encyclopedia DNABook
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC01044 |
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| 名称データベースの名称 | RIKEN Arabidopsis cDNA Encyclopedia DNABook |
| 別称データベースの別称 | ― |
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://219.121.17.221/DNABook_DB/VIEW/Book_Top.php?BOOK_ID=BOOK_4 |
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | 国立研究開発法人理化学研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | 日本 |
| 説明データベースの説明 | 理研で保有するシロイヌナズナの転写因子の完全長cDNAクローンを固定したDNAブックです。研究グループでこれまでに単離したシロイヌナズナ完全長cDNAクローン中に、転写因子をコードすることが予想されるクローンが1,069個存在しており、これら1,069個のシロイヌナズナ転写因子を1冊の本に収めました。この「シロイヌナズナDNAブック」では、転写因子はファミリー毎に分類された状態でスポットされており、各転写因子ファミリーを研究する植物研究者にも利用しやすい形になっています。 スポットした転写因子の詳細情報（機能モチーフ、マイクロアレイ解析による発現プロファイル、選択的スプライシング、Ac/Dsトランスポゾン挿入変異系統、などの情報）は、シロイヌナズナの全転写因子を扱うデータベースRARTF (RIKEN Arabidopsis Transcription Factor Database; http://rarge.gsc.riken.jp/rartf/ ）より公開されています。 |
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Arabidopsis thaliana (3702) |
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI | ― |
| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 日本語, 英語 |
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 運用終了 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先 | ― |
| API / SPARQL endpoint | ― |
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― |
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― |
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― |
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | ― |
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース |
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| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog |
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2011-12-08 |
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2015-08-20 |
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |