データベースのレコード一覧 (件数: 2583)
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運用機関:
Lab of bioinformatics and computational genomics (BIOBIX)
生物種:
説明:
リボソームプロファイリングを用いて同定された 短いオープンリーディングフレーム(sORF) のデータベースです。リボソームプロファイリングからsORF を同定し、最先端のツールと測定基準を組み込み、結...
運用機関:
Australian National Data Service (ANDS), eResearch Centre, Monash University
生物種:
説明:
ハイスループットデータセット（マイクロアレイ、プロテオミクスデータなど）から個々のインターフェロン調節遺伝子（IRG）または IRG のシグネチャーを高い信頼性の下で同定することができるデータベースで...
運用機関:
BioVeL, Encyclopedia of Life, Natural History Museum, Pensoft Publishers, The Biodiversity Heritage Library (BHL), Virtual Biodiversity Research and Access Network for Taxonomy (ViBRANT), Vizzuality, e-monocot project
生物種:
All
説明:
誰もが自分のデータを共有して独自の研究ネットワークを作成できる、生物多様性研究者のためのオンライン仮想研究環境です。オンライン登録フォームを入力した研究者には無料でサイトが提供されます。このサイトはロ...
運用機関:
生物種:
Homo sapiens
説明:
結腸直腸癌の細胞株および組織に関連するゲノムおよびプロテオームを統合したオンラインリソースです。
カタログ化されたデータには、定量的および非定量的タンパク質発現、配列変異、細胞シグナル伝達経路、タンパ...
運用機関:
Bioinformatics and Computational biology Unit, Molecular genetics Lab, University of Rome Tor Vergata
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus
説明:
学術的な文献に掲載されているシグナリング情報を構造的に整理し、保存するオープンリソースです。得られた情報は、生物学的実体間の二元因果関係として保存され、活動フローとして図式的に表示することができます。...
運用機関:
University of Rome Tor Vergata
生物種:
Viruses
説明:
VirusMenthaはIMExコンソーシアムに関わるタンパク質ータンパク質データベースから手動キュレーションしたウイルス相互作用のコレクションです。タンパク質ータンパク質相互作用に関する情報を手動で...
運用機関:
生物種:
All
説明:
証拠として保存されている博物学コレクションの電子的情報を収録した米国の国家的リソースです。数百万の生物標本について採集地、作成者、タキソノミーと画像を収録しています。
運用機関:
生物種:
Homo sapiens
説明:
公開されている転写因子のクロマチン免疫沈降シーケンス（ChIP-seq）実験結果をEncodeデータセットと統合した、包括的解析のためのリソースです。転写因子（TF）、転写コアクチベーター（TCA）、...
運用機関:
Beth Israel Deaconess Medical Center, Boston Children's Hospital, Division of Sleep & Circadian Disorders, Brigham and Women's Hospital/Harvard Medical School, Dana-Farber Cancer Institute, Harvard Medical School, Massachusetts General Hospital, National Cancer Institute
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
プラスミドの配列決定とプラスミドサービスを廉価に提供するサービスです。ベクターの名前、種類、サイズ、クローンの挿入配列などが収録されています。ほとんどのヒトの cDNA および shRNA ライブラリ...
運用機関:
US National Institute of Mental Health (NIMH)
生物種:
Homo sapiens
説明:
米国国立精神衛生研究所（National Institute of Mental Health）が資金を提供する臨床試験のデータを共有するための情報科学プラットフォームです。本データベースは、米国国立...
運用機関:
US National Institute of Mental Health (NIMH)
生物種:
Homo sapiens
説明:
メンタルヘルス研究に関連する被験者データを共有するための情報科学プラットフォームです。データ提出の計画、データの共有、既に共有されているデータの照会、出版物や検索結果に関連する研究結果の共有のために使...
運用機関:
University of Indiana
生物種:
All
説明:
最新のDNAおよびタンパク質の生物学的配列を収録したデータバンクへの高速アクセスを提供するバイオインフォマティクスにおける世界的な公共サービスです。 Bio-mirrorの各国サイトとダウンロードサイ...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information (NCBI)
生物種:
All
説明:
投稿者から提供された、実験アッセイに利用される生体物質に関する記述的情報またはメタデータを保管するデータベースです。NCBI の主要なデータアーカイブに収録されているデータは、本データベースから取得さ...
運用機関:
The Institute for Quantitative Social Service, Harvard University, Harvard Medical School, SBGrid Consortium
生物種:
All
説明:
X線回折、MicroED、LLSM データセット、構造モデルを含む実験データを登録、保管、公開するためのデータベースです。 PBD ID、独自の回析画像、サンプル情報、データセットの種類、研究室へのリ...
運用機関:
生物種:
All
説明:
NIH の Metabolomics Resource Cores（RCMRC）やその他の NIH が資金提供したプロジェクトにより生成された実験データをオンラインインタフェースにより検索および分析で...
運用機関:
University of Illinois at Chicago
生物種:
All
説明:
遺伝子融合、複数の RNA スプライシング変異体、または多面発現によらずに複数の生化学的機能を持つ単一のポリペプチド（ムーンライティングタンパク質）のデータベースです。ムーンライティングタンパク質であ...
運用機関:
Laboratory of Neuro Imaging (LONI), University of Southern California
生物種:
Homo sapiens
説明:
PPMI は、パーキンソン病における進行マーカーを確認するための観察臨床試験に関するサイトです。パーキンソン病の進行に関するバイオマーカーを特定するために用いられる臨床データ、画像データ、バイオサンプ...
運用機関:
University of Oxford, University of Minnesota, Washington University in St Louis, Radboud University
生物種:
Homo sapiens
説明:
多数の健常な成人におけるヒトのコネクトームを可能な限り正確にマッピングし、科学コミュニティに自由に利用できるようにしたリソースです。若い健常成人のMRによる神経画像と行動データ、成熟した高齢者の脳変化...
運用機関:
University of California San Diego
生物種:
Caenorhabditis elegans | Danio rerio | Drosophila melanogaster | Mus musculus
説明:
NIDDK のミッションに関連する大規模なデータプールへのアクセスを提供するリソースです。dkNET ポータルには、抗体、ベクター、マウスの系統、データ、プロトコル、文献などといった研究リソースに関す...
運用機関:
生物種:
Homo sapiens
説明:
NIDDK が資金を提供する臨床研究のうち、指定されたものから収集されたバイオサンプル、遺伝学的データおよびその他のデータを保存するレジストリです。研究の種類、器官組織、疾患状況などによる絞り込みが可...
運用機関:
Beth Israel Deaconess Medical Center, Laboratory for Computational Physiology (LCP), Massachusetts Institute of Technology (MIT), Philips Healthcare
生物種:
Homo sapiens
説明:
2001〜2012年の間にBeth Israel Deaconess Medical Centerに関わった患者の医療データを収録したデータベースです。性別、年齢、居住地域、職業、学歴などの人口統計学...
運用機関:
Harvard Stem Cell Institute, Oxford e-Research Centre, Department of Engineering Science, University of Oxford
生物種:
Danio rerio | Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus
説明:
ハーバード幹細胞研究所（Harvard Stem Cell Institute）によって創設された、幹細胞データの共有、処理、解析を行うことができるオープンソースです。幹細胞に関するデータセットを、キ...
運用機関:
trans-national infrastructure for plant genomic science (transPLANT), Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK)
生物種:
Viridiplantae
説明:
Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK) およびドイツ植物表現型ネットワーク（DPPN：German Plan...
運用機関:
Centre sur la Biodiversite de l'Universite de Montreal
生物種:
All
説明:
分類学的、地理的、時間的、数値的、歴史的情報を豊富に含む生物学的コレクションのレポジトリです。ほとんどのデータセットには標本データが含まれていますが、データクオリティテストのチェックリストと観測地のデ...
運用機関:
The Reference Center on Environmental Information (CRIA)
生物種:
All
説明:
ブラジル･サンパウロ州内で収集された主要な生物多様性データ、および SinBiota データベースに登録された他のネットワークや観測データから統合されたデータを取得するためのサイトです。データの概要、...
運用機関:
Muséum National d'Histoire Naturelle (MNHN)
生物種:
Fulgoroidea | Fulgoromorpha | Hemiptera | Insecta
説明:
経済的に重要な科であるウンカ（Hemiptera、Fulgoromorpha）の公開されている生物学的な一次データについての概要を提供するオンラインデータベースです。分類、命名法、文献、分布の情報なら...
運用機関:
Museum of Vertebrate Zoology at Berkeley (MVZ), University of Colorado Boulder
生物種:
All
説明:
世界中の出版社がウェブ上で公開している生物多様性のデータに自由かつオープンにアクセスできるようにすることを目的とした共同プロジェクトです。歴史的に、脊椎動物のデータに重点が置かれていますが、任意の生物...
運用機関:
Neuroimaging and Informatics Institute, University of Southern California (USC)
生物種:
Homo sapiens
説明:
ニューロイメージングと関連する臨床データのアーカイブです。北米および欧州の数十の神経イメージング研究プロジェクトに利用され、MRI、PET、MRA、DTI、および他の画像様式を収載しています。また、さ...
運用機関:
生物種:
Homo sapiens
説明:
免疫寛容データの管理および可視化のポータルサイトです。公開された研究から取得された臨床研究とバイオリポジトリのデータは、全てのユーザーがアクセス可能です。現在進行中の研究に関するデータは、調査研究者や...
運用機関:
Center for Expanded Data Annotation and Retrieval (CEDAR), Human Immunology Project Consortium, ISA-Tools, University of Oxford, Northrop Grumman Health IT, Stanford University, Technion - Israel Institute of Technology, University at Buffalo, University of California-San Francisco, Accelerating Medicines Partnership (AMP)
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
主に NIAID / DAIT から資金提供を受けた研究者により生成された、免疫学研究データを収録する、長期的かつ持続可能なアーカイブです。研究のタイプ、疾患名、研究計画、アセスメント、薬剤などの情報...
運用機関:
Mouse Genome Informatics (MGI)
生物種:
Mus musculus
説明:
実験用マウスから得られた遺伝子発現情報を扱うコミュニティリソースです。遺伝子名、配列マップ、ホモロジー、変異と表現型、文献などの情報を収録しています。さまざまなタイプの発現データを保存して統合し、ユー...
運用機関:
生物種:
Caenorhabditis elegans | Drosophila melanogaster | Felis catus | Homo sapiens | Macaca mulatta | ...
説明:
脳の膨大なコネクトームデータセットを収集、解析、視覚化するデータベースです。OCP （OPEN CONNECTOME PROJECT）、MRI Cloud、モデル生物のコネクトーム、シナプス研究、透明...
運用機関:
University of Michigan
生物種:
Archaea | Bacteria
説明:
細菌および古細菌のリボソームオペロン（rrn）のコピー数をキュレーションして提供する一般公開されたリソースです。16S や 23SのリボソームRNAをコードする遺伝子のコピー数と生物種、NCBI Bi...
運用機関:
Center for Open Science (COS)
生物種:
All
説明:
OSFは、研究ライフサイクル全体（計画、実行、報告、アーカイブ化、発見）をサポートするフレームワークです。機能は次のとおりです：自動バージョン管理、すべてのアクションのロギング、連携サポート、無制限の...
運用機関:
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒトに関係する脱リン酸化酵素のデータベースです。活性型脱リン酸化酵素、実験で確認されたそれらのタンパク質および非タンパク質の基質、脱リン酸化部位の情報、関与するパスウェイを手作業でキュレートしています...
運用機関:
BioComputing laboratory, University of Padua, Institue of Molecular Biology, gGmbH, Structural Bioinformatics and Molecular Modelling Group, CRBM
生物種:
All
説明:
アノテーションを付したタンデムリピートタンパク質構造のデータベースです。最先端のリピート検出法と手作業のキュレーションを利用して、タンパク質データバンクに体系的にアノテーションを付けるとともに、リピー...
運用機関:
University of Padova
生物種:
All
説明:
タンパク質の天然変性（disorder）と可動性に関するアノテーションのデータベースです。DisProtデータベースから手動で抽出されたキュレーションデータ、実験データに基づき PDB 構造から推定さ...
運用機関:
Link-Group, NetBiol, Semmelweis University, Hungary
生物種:
Caenorhabditis elegans | Drosophila melanogaster | Homo sapiens | Saccharomyces cerevisiae
説明:
タンパク質-タンパク質間相互作用ネットワーク解析のための複数のデータベースから情報を統合した、相互作用、タンパク質、およびその局在に関する定性的な情報を提供するデータベースです。分布領域、分布レベル、...
運用機関:
Fiocruz Minas Centro de Pesquisas Rene Rachou (CPQRR), St Vincent's Institute, Department of Biochemistry, University of Cambridge
生物種:
All
説明:
突然変異とタンパク質-リガンド親和性の変化についてのデータベースです。実験データを文献から手動でキュレートし、タンパク質-リガンド複合体の３次元構造と関連づけています。タンパク質名、変異位置、結合サイ...
運用機関:
University of Warsaw
生物種:
All
説明:
ノット構造やスリップノット構造を有するタンパク質に関する情報を収録するデータベースです。タンパク質のノット構造の複雑さを、全ポリペプチド鎖および各部分鎖の結び目のタイプを示したマトリックス図の形で提示...
運用機関:
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒトにおけるレトロトランスポゾン挿入のデータベースです。健常または病理学的なヒト試料で同定され、査読済みジャーナルで発表されたL1-HS 挿入多型に関する情報をキュレーションし、挿入位置、サンプル情報...
運用機関:
生物種:
説明:
Bio2RDF は、セマンティックウェブ技術を使用し、リンクした生命科学データの最大のネットワークを構築し、提供するオープンソースプロジェクトです。複数のデータプロバイダから得られた様々なフォーマット...
運用終了
Nuclear Receptor Signaling Atlas: NURSA
運用機関:
Baylor College of Medicine
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus
説明:
ヒトの生理と疾患における核内受容体（NR）および共調節因子などの情報を収録したリソースです。NR、共調節因子、リガンドについての遺伝子、RNA、タンパク質、構造、タンパク質相互作用、および関連する疾患...
運用機関:
生物種:
Homo sapiens
説明:
神経システムの計算モデルを共有し、共同開発するためのリソースです。 神経モデルの形態、文献、参加などの情報を収録しています。プロジェクト名や神経システム（細胞とネットワーク）によるツリーからの検索が可...
運用機関:
Cambridge Systems Biology Centre, University of Cambridge, Mouse Genome Informatics (MGI)
生物種:
Mus musculus
説明:
InterMineを使用し、MGI（Mouse Genome Informatics）のマウスデータを統合したデータベースです。ホモロジー、タンパク質、相互作用、遺伝子オントロジー、発現、調整、表現型...
運用機関:
Cambridge Systems Biology Centre, University of Cambridge
生物種:
Anopheles gambiae | Caenorhabditis elegans | Drosophila melanogaster
説明:
ショウジョウバエ、ハマダラカ、および線虫のゲノム、発現およびタンパク質データの統合データベースです。データが統合されているため、生物学的知識の領域にまたがる高度なデータマイニングクエリの実行が可能です...
運用機関:
National Institute of Health
生物種:
Mus musculus
説明:
トランスポゾンに基づく順遺伝学的スクリーニングを用いて同定したマウスの癌候補遺伝子を広めるために開発されたデータベースです。遺伝子名、ヒト遺伝子における名称、相同遺伝子、報告文献、がんのタイプ、遺伝子...
運用機関:
生物種:
All
説明:
Environmental Data Initiative （EDI）による環境関連データのデータベースです。NSF DEB が資金提供するプロジェクトで得られたデータに重点を置いています。環境生物学...
運用機関:
Pasteur Institute of Morocco
生物種:
Homo sapiens
説明:
モロッコ人集団に関して報告された変異と多型頻度を収集し、文書化したデータベースです。研究者や臨床医は、MGDD に含まれる情報を利用して、特定の疾患または遺伝子に関係する変異を見つけることができます。...
運用機関:
生物種:
All
説明:
システムバイオロジー分野において、ODE ベースの動態モデルを構築することができるユーザーフレンドリーなプラットフォームです。代謝物濃度（時系列および定常状態）、フラックスデータ、および酵素測定値を含...
本カタログの使い方
統合TVにて解説動画が公開されています (2017年10月04日 版）