データベースのレコード一覧 (件数: 2596)
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生物種
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その他
運用機関:
Institute of Molecular Genetics of the ASCR, v.v.i.
生物種:
Mus musculus
説明:
マウスの様々な組織や細胞株から生成された SAGE (Serial Analysis of gene expression) ライブラリのデータベース。
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 系統生物研究センター・哺乳動物遺伝研究室
生物種:
Mus musculus
説明:
国立遺伝学研究所系統生物研究センター哺乳動物遺伝研究室において維持されているマウス系統に関する情報、及びそれらのマウス系統を用いた遺伝解析に必要な基礎情報を提供しています。
運用機関:
University of Connecticut, University of Nevada
生物種:
説明:
タンパク質内に存在する短い近接するペプチドモチーフに関するデータベースです。Minimotifとは少なくとも２つ以上のタンパク質で機能が知られたもので、翻訳語修飾、タンパク質やその他分子への結合、タン...
運用終了
MAEDA: Micro Array Expression DAta search
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana
説明:
シロイヌナズナの遺伝子発現データベース。 RARGE- RIKEN Arabidopsis Genome Encyclopedia：http://rarge.gsc.riken.jp/index.ht...
運用機関:
The University of Queensland
生物種:
Mus musculus
説明:
理研のFANTOM3のタンパク質配列セットに対して、膜組織や細胞内局在性に関する情報を人の手で付加したデータのデータベース。膜組織は MemO pipeline を用いて予測しており、細胞内局在は免疫...
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
生物種:
Oryza sativa
説明:
九州大学大学院農学研究院附属遺伝子資源開発研究センター植物遺伝子開発分野が収集および保存しているイネ品種・系統のデータベース。国内外の品種系統(HO系統、1,398 系統)、FAO国際共同研究供試品種...
運用終了
INE 稲: INtegrated Rice Genome Explorer
運用機関:
国立研究開発法人農業生物資源研究所
生物種:
Oryza sativa
説明:
イネの染色体の連鎖地図、物理地図、EST Mapを掲載しています。
なお、本サイトは運用を停止し、データはWhoGA (http://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc...
運用機関:
CNRS (The National Center for Scientific Research), Montpellier University, Montpellier
生物種:
説明:
ヒトおよびその他の脊椎動物の免疫グロブリン、T細胞受容体に関するアノテーションが付与された配列のデータベースです。
運用終了
IARC TP53 Database
運用機関:
International Agency for Research on Cancer
生物種:
Homo sapiens
説明:
p53の変異、遺伝病、その解析結果のデータベースです。
運用機関:
The Centre for Applied Genomics
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒトゲノムの重複断片のデータベース。
運用機関:
Universita degli Studi del Sannio di Benevento
生物種:
Homo sapiens
説明:
GenBankから抽出したヒトのエキソン、イントロン、スプライス領域のデータセットを提供しています。
運用終了
Hoppsigen: Homologous Processed Pseudogenes database
運用機関:
Pole BioInformatique Lyonnais
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
プロセス型偽遺伝子のデータベース。
運用終了
HOVERGEN: Homologous Vertebrate Genes Database
運用機関:
Pole BioInformatique Lyonnais
生物種:
説明:
ACNUC sequence databaseを下地とした脊椎動物遺伝子のデータベース。FamFetch application をインストールすると、GUIからアライメントや系統樹を見ることができま...
運用終了
RIKEN Hub Database Project
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Caenorhabditis elegans | Arabidopsis thaliana
説明:
タイリングアレイ（遺伝子発現情報）とゲノム情報を組み合わせて統計的に解析することにより、遺伝子の構造を高い精度で推定する新しい情報処理技術を開発しました。この技術をシロイヌナズナのデータに適用し、これ...
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
生物種:
説明:
GeneOntology、TraitOntology、Taxonomyのデータ構造のビューア。元のデータはGene Ontology Database http://www.godatabase.or...
運用機関:
The Invasive Species Specialist Group
生物種:
説明:
全世界の侵入生物種（invasive species）に関するデータベース。
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
説明:
ゲノムネットは、生物学・医学に関連したさまざまなデータベースと解析ツールが誰でも自由に利用できるインターネットサービスです。世界中に存在する生物学・医学関連の多様なデータベースを、各研究者のデスクトッ...
運用機関:
Genomics Institute of the Novartis Research Foundation
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
ヒトおよびマウスの遺伝子発現情報データベース。
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
All
説明:
公に利用できる注釈付きDNA配列のデータベース。 The International Nucleotide Sequence Database Collaborationの一部。 the DNA Da...
運用機関:
Office of Biotechnology Activities
生物種:
Homo sapiens
説明:
NIHにより登録されたヒトの遺伝子導入研究に関する情報を提供するデータベースです。研究対象となる疾患、研究に使用される遺伝子産物、遺伝子産物の配布情報、プロトコルの概要等を収録しています。プロトコル、...
運用機関:
University of Washington
生物種:
Homo sapiens
説明:
人体の解剖学における用語を統一するための情報データベースです。ヒトの体の解剖学の用語について、人間にもコンピュータにも理解できるようにオントロジーをフレームワーク化しています。
このサイトはオープンソ...
休止
FMRIDC: The fMRI Data Center
運用機関:
University of California
生物種:
Homo sapiens
説明:
機能的磁気共鳴映像法（fMRI）データの集積所としての役割をはたしているサイトです。
運用機関:
FishBase Consortium
生物種:
説明:
世界中に生息する魚類の詳細な情報を集めたデータベースです。学名、一般名、生態写真、分類、生息地、サイズ、参考文献などの情報を収録しています。学名と日本語、中国語、アラビア語、ロシア語、ギリシャ語、タイ...
運用機関:
Cardiff University School of Medicine
生物種:
Homo sapiens
説明:
世界中の遺伝病に関する情報を文献から収集・整理したデータベース。
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
生物種:
Metazoa
説明:
実験動物の情報データベースです。日本実験動物協会が収集及び提供する動物実験関連情報を検索することができます。
運用機関:
Swiss Institute of Bioinformatics
生物種:
説明:
オリゴペプチド配列のデータベース。オリゴペプチドの構造、機能、翻訳後修飾等、クォリティの高いアノテーションを提供しています。
運用機関:
Swiss Institute of Bioinformatics
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
酵素の分類、名前、機能、基質、生成物、阻害剤などを登録したデータベースです。
運用終了
EGO: Eukaryotic Gene Orthologues
運用機関:
Dana-Farber Cancer Institute
生物種:
Eukaryota
説明:
真核生物のオーソロガス遺伝子のデータベースです。
Dana-Farber Cancer InstituteによるEGOの運用は終了しました。EGOのデータはTGIのFTPサイト （ftp://occ...
運用機関:
SRI International
生物種:
Escherichia coli
説明:
大腸菌のゲノム、代謝産物、代謝経路に関する情報データベースです。文献から得られた遺伝子、遺伝子産物（タンパク質、酵素）、関連するパスウェイ、遺伝子の位置などの情報やパスウェイマップが収録されています。...
運用機関:
Institute of Genome Sciences, University of Maryland School of Medicine
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒトの疾患に関する用語や概念について整理したDisease Ontologyを提供するサイトです。MeSH、ICD、NCI’s thesaurus、SNOMEDやOMIMへリンク付けられています。キー...
運用機関:
European Bioinformatics Institute
生物種:
説明:
ゲノム上の構造多型データベース。すべての生物種および表現型の生物の構造多型を対象に登録されたデータを、閲覧、ダウンロードすることができます。収録データは、構造多型、ゲノム上の挿入(insertions...
運用機関:
Salk Institute
生物種:
説明:
転写因子CREB（cyclic AMP response element-binding protein：cAMP応答配列結合タンパク質）の標的遺伝子のデータベースです。データベース内の各遺伝子には以...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
説明:
蛋白質の保存されたドメイン構造についてのアノテーションデータベースです。
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Homo sapiens | Arabidopsis thaliana | Aspergillus nidulans | Bacillus subtilis | Bombyx mori | ...
説明:
各種生物のコドンテーブルを掲載。
運用終了
CGAP: The Cancer Genome Anatomy Project
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
種々の臓器における正常、前癌、癌の各細胞で発現している遺伝子を収録したデータベースです。米国立癌研究所（NCI）のプロジェクトで、正常、前がん状態、がん細胞の発現プロファイルを決定し、がんの発見や診断...
運用機関:
The University of Alabama
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus | Drosophila melanogaster | Caenorhabditis elegans
説明:
遺伝性てんかんの包括的なデータベースで、遺伝子の情報や論文情報を閲覧できます。また新規データの登録も受付けています。
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
CAGE法によって集められたRNAライブラリやCAGEライブラリなどのデータを検索、閲覧するシステムです。CAGE(Cap Analysis Gene Expression)法とは、遺伝子プロモーター...
運用終了
Blocks
運用機関:
Fred Hutchinson Cancer Research Center
生物種:
Homo sapiens
説明:
類似タンパク質のアミノ酸配列のマルチプルアライメントから自動的に抽出したモチーフのデータベースです。
運用機関:
SRI International
生物種:
Agrobacterium tumefaciens | Bacillus subtilis | Caulobacter vibrioides | Chlamydia trachomatis | Escherichia coli O157:H7 | ...
説明:
各種生物の代謝マップが納められたパスウェイデータベースです。
運用終了
Bio-Resourse Network
運用機関:
独立行政法人科学技術振興機構
生物種:
説明:
Bio-Resourse Networkの各種システムは、微生物株の分類同定を支援し、ユーザの研究資材データベース作成を支援します。
運用機関:
研究用植物データベース作成グループ
生物種:
Embryophyta
説明:
施設に保存されている研究用植物のデータベース。日本全国の植物園などの施設に系統保存されている植物データの登録・公開を行っています。
運用機関:
The Consortium for the Barcode of Life (CBOL)
生物種:
説明:
DNAバーコード （生物種を特徴付ける短いDNA配列）のデータベースです。
以下の4つのデータベースで構成されています。
（1）「Public Data Portal」 公開されたバーコード情報を収録...
運用機関:
Bird Studies Canada
生物種:
Aves
説明:
全世界に生息する鳥に関するデータベース。鳥の分布、分類、同義語、各言語での名称表記法（日本語もある）等を見ることができ、分布は世界地図（画像）で見ることができます。鳥の調査のために世界各地を訪れた際の...
運用機関:
The National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)
生物種:
Anopheles gambiae | Aedes aegypti
説明:
ガンビエハマダラカ、ネッタイシマカなどのマラリアを媒介する蚊の種名情報やゲノム情報のデータベースです。
運用機関:
American Museum of Natural History
生物種:
Amphibia
説明:
世界に生息する両性類の種のデータベース。階層化された両生類の生物学上の分類が表示され、各分類（網:class、目:order、科:family、亜科:subfamily、属:genus、種:speci...
運用機関:
Johns Hopkins University
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒト血漿タンパク質とそのisoformの包括的リソースです。Isoform特異的発現、関連する疾患、局在、翻訳後修飾、一塩基多型の情報が収集されています。このデータベースで提供される情報は、徹底的な文...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
Homo sapiens | Canis lupus familiaris | Macaca mulatta | Pan troglodytes | Mus musculus | ...
説明:
大規模なゲノム構造変異（挿入、欠失、転座、逆位など）に関する情報を収録しています。
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
説明:
クロマチン修飾（ヒストン修飾、DNAメチル化、DNA分解酵素フットプリント法）のゲノム網羅的研究結果を収録しています。一研究につき、サンプル情報、アッセイの種類、データソース、文献情報が登録されており...
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統合TVにて解説動画が公開されています (2017年10月04日 版）