English
Menu

レコード詳細

Thumbnail

SEAweb: Small RNA Expression Atlas

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02593
名称データベースの名称 SEAweb
別称データベースの別称 Small RNA Expression Atlas
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://sea.ims.bio
運用機関名現在データベースを運用している機関名 ZMNH Institute of Medical Systems Biology
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 ドイツ
説明データベースの説明 低分子RNA （miRNA、piRNA、snoRNA、snRNA、siRNA）に関するデータベースです。 多くの疾患データセットや高品質の予測miRNAを含む公開されたデータをOasis2で再分析したsRNA発現情報を収録しています。 さらに、sRNAの差次的発現、sRNAベースの分類、細菌およびウイルスからの病原性sRNAシグネチャ、病原体の差次的発現も収録しています。 また、miRNAに関連する遺伝子標的や疾患も含まれています。細胞、組織、疾患、予測miRNAなどによる絞り込みが可能です。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Homo sapiens (9606), Bos taurus (9913), Mus musculus (10090), Rattus norvegicus (10116), Caenorhabditis elegans (6239), Anopheles gambiae (7165), Drosophila melanogaster (7227), Danio rerio (7955), Gallus gallus (9031), Sus scrofa (9823)
タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:31598718
DOI:10.1093/nar/gkz869
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク ―
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 ―
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 ―
データベースの使い方 https://sea.ims.bio/documentation
データベースの連絡先 https://sea.ims.bio/documentation
API / SPARQL endpoint ―
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク ―
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク ―
統合TVへのリンク統合TVへのリンク ―
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク ―
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2021-11-30
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2021-11-30
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license