レコード詳細
LncBook
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC02541 | ||||
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| 名称データベースの名称 | LncBook | ||||
| 別称データベースの別称 | ― | ||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | https://ngdc.cncb.ac.cn/lncbook/ | ||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | BIG Data Center, Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences | ||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | 中国 | ||||
| 説明データベースの説明 | Long non-coding RNAs (lncRNAs)とオミクスデータ、機能情報、疾患とを関連づけるデータベースです。ヒトのlncRNAデータをGENCODE v27、NONCODE v5.0、LNCipedia v4.1、MiTranscriptome betaから収集し、コード情報、塩基配列、ゲノムブラウザー、発現、メチル化、変異、LncRNA-miRNA 相互作用、疾患に関する情報を統合しています。転写、疾患、機能などからの絞り込みが可能です。BLAST、コーディング予測、ゲノム位置アノテーションのツールも備えています。 | ||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Homo sapiens (9606) | ||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 | ||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ftp://download.big.ac.cn/lncbook | ||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― | ||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | https://bigd.big.ac.cn | ||||
| データベースの使い方 | ― | ||||
| データベースの連絡先 | https://bigd.big.ac.cn/lncbook/contact | ||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | https://fairsharing.org/biodbcore-001262/ | ||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||
| レコード管理者レコード管理者 | See the corresponding part in the FAIRsharing record | ||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2020-09-08 | ||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2024-05-09 | ||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |