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pEVE: predicted endogenous viral elements in eukaryotic genomes

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02512
名称データベースの名称 pEVE
別称データベースの別称 predicted endogenous viral elements in eukaryotic genomes
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://peve.med.u-tokai.ac.jp/
運用機関名現在データベースを運用している機関名 東海大学 医学部 (J-Globalへのリンク)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 日本
説明データベースの説明 真核生物ゲノム内に存在するウイルスゲノム様配列(endogenous viral element:EVE)の予測データベースです。GenomeSync databaseから得られた真核生物およびウィルスのゲノムの配列についてターゲットとクエリの双方としてBLASTN 検索した内因性ウイルス様配列を予測し、参考文献、塩基長、ヒットスコア、配列などを収録しています。dsDNA、dsRNA、ssDNA、ssRNA、otherの結果に分けてダウンロードが可能です。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Eukaryota (2759), Viruses (10239)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:29425804
DOI:10.1016/j.virusres.2018.02.002
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク http://peve.med.u-tokai.ac.jp/data-download/
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 http://peve.med.u-tokai.ac.jp/data-download/
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件
データベースの使い方
データベースの連絡先 http://peve.med.u-tokai.ac.jp/faq/
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
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レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2020-03-31
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2020-03-31
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license