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NucMap

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02485
名称データベースの名称 NucMap
別称データベースの別称 ―
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://bigd.big.ac.cn/nucmap/
運用機関名現在データベースを運用している機関名 BIG Data Center, Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 中国
説明データベースの説明 生物種を超えたゲノムワイドなヌクレオソーム配置マップのデータベースです。 ヌクレオソームの位置情報を１ヌクレオチドの解像度で照会および視覚化します。生物を選んでゲノムをブラウジングするか、生物と目的遺伝子/転写物を選び、目的遺伝子/転写物周辺のヌクレオソーム数情報を閲覧することができます。サンプルサーチからは、サンプルごとの生物種、実験方法、文献情報などの情報が収録されています。また関連するオミクス情報とGEOリンクも収録されています。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Arabidopsis thaliana (3702), Caenorhabditis elegans (6239), Candida albicans (5476), Danio rerio (7955), Drosophila melanogaster (7227), Homo sapiens (9606), Mus musculus (10090), Neurospora crassa (5141), Oryza sativa (4530), Plasmodium falciparum (5833), Saccharomyces cerevisiae (4932), Schizosaccharomyces pombe (4896), Trypanosoma brucei (5691), Xenopus laevis (8355), Zea mays (4577)
タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:30335176
DOI:10.1093/nar/gky980
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク https://bigd.big.ac.cn/nucmap/Download.php
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 ―
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 ―
データベースの使い方 ―
データベースの連絡先 https://bigd.big.ac.cn/nucmap/Contactus.php
API / SPARQL endpoint ―
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク ―
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク ―
統合TVへのリンク統合TVへのリンク ―
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク ―
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2019-11-19
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2022-05-22
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license