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YanHuang - YH1 Genome Database: YH1

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC01722
名称データベースの名称 YanHuang - YH1 Genome Database
別称データベースの別称 YH1
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://yh.genomics.org.cn
運用機関名現在データベースを運用している機関名
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 中国
説明データベースの説明 アジア人口の代表として、漢民族個人の全DNA配列を提示するデータベースです。YH と名付けられたこのゲノムは、Illumina Genome Analyzer によって生成された 33 億個のリード(117.7 Gbp の生データ)に基づき、3 年間で中国人100人の配列決定を行うことを目指す YanHuang Project の出発点となります。合計で 102.9 Gbp のヌクレオチドが自己開発ソフトウェア SOAP(Short Oligonucleotide Alignment Program)によって NCBI ヒト参照ゲノム(Build 36)上にマッピングされ、307万個の SNP が同定されました。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
言語データベースの内容の記載に使用されている言語
稼動状況データベースの稼動状況 休止
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件
データベースの使い方
データベースの連絡先
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.6cnw23
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 See the corresponding part in the FAIRsharing record
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2019-03-28
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2020-07-08
本レコードの利用条件 Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license