レコード詳細
EndoDB: Endothelial cell database
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC02470 | ||||
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| 名称データベースの名称 | EndoDB | ||||
| 別称データベースの別称 | Endothelial cell database | ||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | https://endotheliomics.shinyapps.io/endodb/ | ||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | VIB-KU Leuven Center for Cancer Biology (CCB) | ||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | ベルギー | ||||
| 説明データベースの説明 | 内皮細胞（endothelial cells; ECs）の遺伝子発現に関するデータベースです。Gene Expression OmnibusおよびArrayExpressから単一細胞RNA-seqデータセットを含む内皮トランスクリプトミクスデータセットを手動でキュレートし、解析したデータを収録しています。各エントリには、主成分分析、差分分析、遺伝子セット濃縮分析、代謝遺伝子発現分析が含まれ、公開準備のできた図表により視覚化されています。全てのデータがダウンロード可能です。 | ||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Homo sapiens (9606), Mus musculus (10090), Danio rerio (7955), Rattus norvegicus (10116), Bos taurus (9913), Sus scrofa (9823) | ||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 | ||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― | ||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― | ||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||
| データベースの使い方 | https://endotheliomics.shinyapps.io/endodb/_w_b40a50a7/session/965c61389514868e2d4215b0c9f659ec/download/exportManual?w=b40a50a7 | ||||
| データベースの連絡先 | transbioinfo@kuleuven.vib.be | ||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | ― | ||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog | ||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2019-10-23 | ||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2022-05-25 | ||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |