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The UCSC Archaeal Genome Browser

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02114
名称データベースの名称 The UCSC Archaeal Genome Browser
別称データベースの別称 ―
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://archaea.ucsc.edu
運用機関名現在データベースを運用している機関名 Department of Biomolecular Engineering, University of California Santa Cruz, Center for Biomolecular Science and Engineering, School of Engineering, University of California Santa Cruz, University of California
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 アメリカ合衆国
説明データベースの説明 古細菌ドメインに属する 100 以上の微生物種の生物学的情報を提供するツールです。基本的な遺伝子アノテーションは、NCBI Genbank / RefSeq のエントリーから抽出されたものです。アノテーションには、複数の種、ヌクレオチドおよびタンパク質モチーフの配列保存、ノンコーディングRNA予測、オペロン予測、およびその他のバイオインフォマティクス分析結果が統合されています。さらに、利用可能な遺伝子発現データ（マイクロアレイまたはハイスループットRNAシークエンシング）が表示されます。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Archaea (2157), Plasmodium falciparum (5833)
タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:16381898
DOI:-
PubMed ID:14681465
DOI:-
PubMed ID:11932250
DOI:-
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク ―
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 ―
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 ―
データベースの使い方 ―
データベースの連絡先 ―
API / SPARQL endpoint ―
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク ―
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク ―
統合TVへのリンク統合TVへのリンク ―
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.12yd2z
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レコード管理者レコード管理者 See the corresponding part in the FAIRsharing record
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2019-03-28
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2020-07-09
本レコードの利用条件 Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license