レコード詳細
休止
MAPPER-2: mapperdb
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC02058 | ||||||||
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| 名称データベースの名称 | MAPPER-2 | ||||||||
| 別称データベースの別称 | mapperdb | ||||||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://genome.ufl.edu/mapperdb | ||||||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | University of Florida | ||||||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | アメリカ合衆国 | ||||||||
| 説明データベースの説明 | 3つのゲノムにおける遺伝子の上流ノンコーディング配列データ情報を掲載し、転写因子結合部位（TFBS）に関する知見を提供するデータベースです。各転写について、スキャンされた領域は転写が開始される上流 10,000bp から配列コーディングが開始される下流 50bp にわたります。したがって、データベースには、遺伝子プロモーターにおける、および初期のイントロンおよびノンコーディングエクソンにおける推定結合部位が含まれます。各推定結合部位について提示される情報には、転写因子名、その位置（染色体上の絶対的位置または遺伝子の相対的位置）、予測スコア、および部位が属する遺伝子の領域などがあります。選択された遺伝子が他の2種類の生物において相同体を有する場合、このプログラムはオプションでその総胴体における推定 TFBS を表示することができます。 | ||||||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Drosophila melanogaster (7227), Homo sapiens (9606), Mus musculus (10090) | ||||||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 休止 | ||||||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― | ||||||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― | ||||||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||||||
| データベースの使い方 | ― | ||||||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.1ex4pm | ||||||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||||||
| レコード管理者レコード管理者 | See the corresponding part in the FAIRsharing record | ||||||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2019-03-28 | ||||||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2019-03-28 | ||||||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |