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BioModels

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC01682
名称データベースの名称 BioModels
別称データベースの別称
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://www.ebi.ac.uk/biomodels/
運用機関名現在データベースを運用している機関名 BioModels.net Team, EMBL-EBI
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 イギリス
説明データベースの説明 生物学や医薬に関連するプロセスやシステムの数理モデルを収集したレポジトリです。シグナリング、タンパク質ー薬剤相互作用、代謝経路など多様な数理モデルの情報を提供しています。提供されるモデルは主にレビューされた科学論文内に記述されたものですが、パスウェイ情報から自動生成されたものもあります。論文情報、フォーマット、概要を、統一した書式で記載しています。すべてのモデルはダウンロードでき、CC0で利用が可能です。また、一部のモデルについては外部データベースへのリンクが手動でキュレートされています。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:25414348
DOI:-
PubMed ID:26225232
DOI:-
PubMed ID:20587024
DOI:-
PubMed ID:16381960
DOI:-
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク https://www.ebi.ac.uk/biomodels/search?query=*%3A*
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 https://www.ebi.ac.uk/biomodels/termsofuse
データベースの使い方
データベースの連絡先
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク https://fairsharing.org/biodbcore-000306
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レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2017-11-21
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2022-05-29
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license