レコード詳細
Plabrain DB: Planarian Brain Database
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC01108 | ||||||||||||||||||||||||
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| 名称データベースの名称 | Plabrain DB | ||||||||||||||||||||||||
| 別称データベースの別称 | Planarian Brain Database | ||||||||||||||||||||||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/plabrain-db/desc.html | ||||||||||||||||||||||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | 京都大学大学院 理学研究科 (J-Globalへのリンク) | ||||||||||||||||||||||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | 日本 | ||||||||||||||||||||||||
| 説明データベースの説明 | プラナリアの神経回路形成に関わる遺伝子群の、単一細胞ごとの遺伝子発現情報、Whole-mount in situ hybridizationによる発現解析、および組織免疫染色による解析データを収録したデータベースです。 特に、FACS (Fluorescence Activated Cell Sorting)を用いた半定量的single-cell PCR (FBSC-PCR)手法による、単一細胞レベルの発現解析結果の初めての公開となります。 京都大学を中心に作成され、生命科学系データベースアーカイブに収録されています。 | ||||||||||||||||||||||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Dugesia japonica (6161) | ||||||||||||||||||||||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 日本語, 英語 | ||||||||||||||||||||||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 | ||||||||||||||||||||||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/plabrain-db/download.html | ||||||||||||||||||||||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/plabrain-db/LATEST/README.html | ||||||||||||||||||||||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/plabrain-db/lic.html | ||||||||||||||||||||||||
| データベースの使い方 | ― | ||||||||||||||||||||||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||||||||||||||||||||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||||||||||||||||||||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/plabrain-db/desc.html | ||||||||||||||||||||||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||||||||||||||||||||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||||||||||||||||||||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | ― | ||||||||||||||||||||||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||||||||||||||||||||||
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog | ||||||||||||||||||||||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2012-02-13 | ||||||||||||||||||||||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2022-01-16 | ||||||||||||||||||||||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |