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LfDB: Lectin Frontier Database

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC00798
名称データベースの名称 LfDB
別称データベースの別称 Lectin Frontier Database
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://acgg.asia/lfdb2
運用機関名現在データベースを運用している機関名 国立研究開発法人産業技術総合研究所 (J-Globalへのリンク)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 日本
説明データベースの説明 レクチンフロンティアデータベース(LfDB)は、レクチンの詳細情報と、各構造を持つ糖鎖との相互作用データを収集、公開しているデータベースです。レクチンと糖鎖(ピリジルアミノ化糖鎖)の相互作用データは、自動化フロンタルアフィニティークロマトグラフィーシステムを用いて取得した定量的データです。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Abrus precatorius (3816), Agaricus bisporus (5341), Agrocybe cylindracea (64608), Aleuria aurantia (5188), Allium sativum (4682), Amaranthus caudatus (3567), Amaranthus cruentus (117272), Anabaena sp. (1167), Anguilla anguilla (7936), Arachis hypogaea (3818), Artocarpus heterophyllus (3489), Arum maculatum (4458), Aspergillus kawachii IFO 4308 (1033177), Aspergillus oryzae (5062), Balanus roseus (509123), Balanus rostratus (399131), Bauhinia purpurea (3806), Bitis arietans (8692), Boletopsis leucomelas (178527), Boletus (5369), Bondarzewia mesenterica (1095465), Bos taurus (9913), Bothrops jararaca (8724), Bufo arenarum (38577), Calystegia sepium (47519), Canavalia brasiliensis (61861), Canavalia ensiformis (3823), Capsicum annuum (4072), Caragana arborescens (20484), Castanea crenata (103480), Ceratobasidium cornigerum (5252), Chlorophyllum molybdites (34430), Cicer arietinum (3827), Clostridium botulinum (1491), Colchicum autumnale (45005), Conger myriaster (7943), Convolvulus arvensis (4123), Cortinarius praestans (222043), Cratylia mollis (252530), Crotalus atrox (8730), Cucumaria echinata (40245), Cycas revoluta (3396), Cytisus scoparius (3835), Datura stramonium (4076), Dioclea grandiflora (3837), Dioscorea batatas (55575), Diospyros kaki (35925), Dolichos lablab (35936), Echis multisquamatus (93050), Erythrina caffra (3842), Erythrina corallodendron (3843), Erythrina crista-galli (49817), Erythrina lysistemon (347910), Erythrina vespertilio (1234622), Escherichia coli (562), Euonymus europaeus (123417), Galanthus nivalis (4670), Gallus gallus (9031), Geodia cydonium (6047), Giardia lamblia (5741), Glycine max (3847), Griffonia simplicifolia (3850), Haemophilus ducreyi (730), Halichondria okadai (163232), Helianthus tuberosus (4233), Helicobasidium purpureum (5574), Helix aspersa (6535), Helix pomatia (6536), Hemitripterus americanus (8094), Hericium erinaceum (91752), Hippeastrum hybrid cultivar (679627), Homo sapiens (9606), Human herpesvirus 4 (10376), Hydra vulgaris (6087), Hypnea japonica (105606), Hypsizygus marmoreus (39966), Laetiporus sulphureus (5630), Lens culinaris (3864), Limax flavus (36461), Limulus polyphemus (6850), Lotus tetragonolobus (3868), Lumbricus terrestris (6398), Lycopersicon esculentum (4081), Lycoris traubii (82237), Maackia amurensis (37501), Maclura pomifera (3496), Macrotyloma uniflorum (271171), Momordica charantia (3673), Morus nigra (85232), Mus musculus (10090), Musa acuminata (4641), Narcissus pseudonarcissus (39639), Nostoc sp. (1180), Oncorhynchus keta (8018), Oryza sativa (4530), Parkia platycephala (185447), Phaseolus lunatus (3884), Phaseolus vulgaris (3885), Phlebodium aureum (218620), Phytolacca americana (3527), Pisum sativum (3888), Plecoglossus altivelis (61084), Pleurotus ostreatus (5322), Polyandrocarpa misakiensis (7723), Polygonatum multiflorum (45371), Psathyrella velutina (71681), Pseudomonas aeruginosa (287), Psophocarpus tetragonolobus (3891), Pteria penguin (113549), Rana catesbeiana (8400), Rattus norvegicus (10116), Rattus rattus (10117), Rhizoctonia solani (456999), Ricinus communis (3988), Salvia viridis (49221), Sambucus ebulus (28503), Sambucus nigra (4202), Sambucus sieboldiana (45463), Scilla campanulata (81759), Sclerotinia (5179), Sinularia lochmodes (301888), Solanum tuberosum (4113), Sophora japonica (3897), Spirinchus lanceolatus (136040), Streptomyces lividans (1916), Streptomyces olivaceoviridis (1921), Sus scrofa (9823), Tachypleus tridentatus (6853), Trichosanthes kirilowii var. japonica (61011), Trimeresurus flavoviridis (88087), Triticum aestivum (4565), Tulipa gesneriana (13306), Ulex europaeus (3902), Urtica dioica (3501), Vicia faba (3906), Vicia villosa (3911), Vigna radiata (157791), Viscum album (3972), Wisteria floribunda (3922), Xenopus laevis (8355)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:17947995
DOI:-
PubMed ID:15943812
DOI:-
PubMed ID:12968376
DOI:-
PubMed ID:12223272
DOI:-
PubMed ID:805787
DOI:-
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 日本語, 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
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レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2011-12-08
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2018-05-27
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license