NBDC00714 - Integbio データベースカタログ

レコード詳細

TMFunction（アーカイブ）: Functional Database of Membrane Proteins

NBDC00714

名称

TMFunction（アーカイブ）

別称

Functional Database of Membrane Proteins

URL

https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/tmfunction/desc.html

運用機関名

国立研究開発法人産業技術総合研究所 (J-Globalへのリンク)

運用機関所在国・地域

日本

説明

α-ヘリックスおよびβ-バレル膜タンパク質中の機能的に重要な残基についてのデータベースです。タンパク質の基本情報やアミノ酸の修飾、変異情報の他、親和性、解離定数、IC50、活性などの実験値を格納しています。実験データは文献から収集しています。Uniprot、PDB、Pubmedなど様々な公共データベースへのリンクを持ちます。国立研究開発法人産業技術総合研究所によるオリジナルサイト（http: //tmbeta-genome.cbrc.jp/TMFunction/）の運用は終了しました。TMFunctionのデータは引き続き生命科学系データベースアーカイブよりご利用いただけます。

生物種

Bacillus halodurans (86665), Bacteriophage M13 (1977402), Bordetella pertussis (520), Bos taurus (9913), Carassius auratus (7957), Clostridium botulinum (1491), Corynebacterium diphtheriae (1717), Cricetulus griseus (10029), Danio rerio (7955), Emericella nidulans (162425), Escherichia coli (562), Escherichia coli O157 (1045010), Escherichia coli UTI89 (364106), Gallus gallus (9031), Helicobacter pylori (210), Homo sapiens (9606), Human herpesvirus 8 (37296), Leishmania donovani (5661), Manduca sexta (7130), Mus musculus (10090), Oryctolagus cuniculus (9986), Pongo pygmaeus (9600), Pseudomonas aeruginosa (287), Rattus norvegicus (10116), Rhodobacter sphaeroides (1063), Rhodopseudomonas blastica (1075), Saccharomyces cerevisiae (4932), Saimiri boliviensis (27679), Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium (90371), Shigella dysenteriae (622), Staphylococcus aureus (1280), Vibrio parahaemolyticus (670), Xenopus (8353), Xenopus laevis (8355)

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