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運用終了

NIG Mouse Genome Database

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC00595
名称データベースの名称 NIG Mouse Genome Database
別称データベースの別称 ―
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://molossinus.nig.ac.jp/mog2/
運用機関名現在データベースを運用している機関名 情報・システム研究機構　国立遺伝学研究所 (J-Globalへのリンク)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 日本
説明データベースの説明 国立遺伝学研究所（NIG）が確立した実験マウス系統の多型情報データベースです。日本の亜種を含む4つのマウス亜種由来の10の近交系（ミシマバッテリー）について全配列ゲノム情報と単一ヌクレオチド多型および短い挿入/削除を含む可視化されたゲノム多型情報を収録しています（MSM、JF1、KJR、SWN、CHD、NJL、BGL2、HMI、BFM、PGN2）。染色体のマップビューワーによるブラウズや系統株などによる絞り込みから、個々の遺伝子について、エクソンやイントロン、アミノ酸配列の相互比較を行うことができます。また、任意の塩基配列の検索、取得も可能です。 国立遺伝学研究所によるオリジナルサイト (http://molossinus.nig.ac.jp/mog2/ ) の運用は終了し、データはMoG+ (https://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc02525 ）のサイトに引き継がれています。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Mus musculus (10090)
タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:23604024
DOI:10.1101/gr.156497.113
PubMed ID:26013919
DOI:10.1007/s00335-015-9569-8
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 運用終了
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク ftp://molossinus.lab.nig.ac.jp/pub/msmdb/
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 ―
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 ―
データベースの使い方 ―
データベースの連絡先 https://www.nig.ac.jp/nig/ja/2018/01/research-highlights_ja/20171225.html
API / SPARQL endpoint ―
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク ―
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク ―
統合TVへのリンク統合TVへのリンク ―
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク ―
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2011-12-08
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2021-08-05
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license