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KCGD: Kyoto Chlamydomonas Genome Database

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC00529
名称データベースの名称 KCGD
別称データベースの別称 Kyoto Chlamydomonas Genome Database
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://www.molecule.lif.kyoto-u.ac.jp/kcgd.html
運用機関名現在データベースを運用している機関名 京都大学 大学院生命科学研究科 (J-Globalへのリンク)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 日本
説明データベースの説明 緑藻クラミドモナスのゲノムデータベースです。データベースの閲覧には、データベース運用者とコンタクトを取ることが必要です。クラミドモナスは、最初に葉緑体DNAが発見された生物で、葉緑体、ミトコンドリアと核の3つのゲノムについてDNA形質転換が可能なことから、光合成、生殖、鞭毛モーターなどの遺伝子研究のモデル生物として世界中で利用されています。研究室ではゲノムライブラリー・EST・cDNAアレイが整備されています。次世代シーケンサーを用いた大規模遺伝子発現解析も進めており、収集した発現データはKCGDから公開する予定です。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Chlamydomonas reinhardtii (3055)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 休止
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件
データベースの使い方
データベースの連絡先
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
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レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2011-12-08
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2017-06-25
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license