サーバ更新のお知らせ
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データベースのレコード一覧 (件数: 2572)
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生物種
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その他
運用機関:
生物種:
All
説明:
あらゆる生物界の生命から得られたペルオキシダーゼ配列のデータベースです。得られた生物種、機能分類（クラス）、配列の情報を収録しています。クラス、生物種、存在する組織や細胞による絞り込みが可能です。また...
運用機関:
Structural Bioinformatics and Network Biology Group
生物種:
All
説明:
高分解能で３次元構造が解明されたタンパク質におけるドメイン - ドメイン間相互作用のコレクションです。構造情報を利用し、相互作用がどのように起こるかを理解する上で必要となる重要な分子の詳細情報（ドメイ...
運用機関:
Wellcome Trust Sanger Institute
生物種:
Vertebrata
説明:
配列決定が完了した脊椎動物のゲノム配列に手作業で付された高品質なアノテーションを収集したリポジトリです。マウスのノックアウトおよびヒトLOF転写産物を含む遺伝子、MHCおよびLRC領域、NODマウスの...
運用機関:
生物種:
説明:
ターゲットタンパク質の登録データベースです。構造決定のために選択されたターゲットタンパク質に関する実験の進行･状態に関する情報を収録しています。
Protein Structure Initiativ...
運用機関:
生物種:
説明:
Protein Data Bank にアーカイブされたタンパク質、核酸、複合体の３次元構造を活用するリソースです。PDBデータの登録、生物種やアミノ酸配列、リガンド、薬剤などによるデータの検索、３次元...
運用機関:
Rutgers, The State University of New Jersey
生物種:
All
説明:
タンパク質と核酸に結合した小分子のデータリソースです。PDBの構造データから特定の低分子を含む構造エントリーを特定し、PDBエントリ内の小分子成分の3D構造をダウンロードするためのツールを提供していま...
運用機関:
Royal Society of Chemistry
生物種:
説明:
ウェブ全体から手動で収集した、化合物に関する情報を自由に利用することができるコレクションです。化学構造および関連情報を、単一の検索可能なリポジトリエントリーに集約しています。これらのエントリーは、追加...
運用機関:
Association of Universities in the Netherlands (VSNU), Data Archiving and Networked Services (DANS)
生物種:
説明:
すべてのオランダの大学、KNAW、NWO、および他の多くの研究機関のリポジトリに収録されているものの、他のデータベースでは参照されていない科学的情報へのオープンアクセスを提供します。文献、データセット...
運用機関:
Rothamsted Research
生物種:
Viruses
説明:
DPVweb は、植物、真菌、原生動物のウイルス、ウイロイド、サテライトに関する情報を提供するデータベースです。各々の科、属の簡単な説明を含む総合的な分類学的情報と、ウイルス配列の分類されたリストを提...
運用機関:
PRABI, Rhone-Alpes Bioinformatics Center
生物種:
All
説明:
代謝パスウェイ予測のための酵素特異的プロファイルデータベースです。ENZYME データベースで利用可能なすべての配列に基づき、完全に配列決定されたゲノム内の酵素を自動的に検出しています。各プロファイル...
運用機関:
Georgetown University Medical Center, PIR, University of Delaware, European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)
生物種:
All
説明:
PIR SuperFamily （成分ドメインではなくタンパク質全体に基づく分類）のコンセプトを使用して、UniProtKB 配列を包括的かつ非重複的にクラスタリングし、進化の関係を表す階層的順序とし...
運用機関:
PBIL
生物種:
Archaea | Bacteria | Eukaryota
説明:
完全に配列決定された生物（細菌、古細菌および真核生物）から得られた相同遺伝子のデータベースです。遺伝子ID、生物種、機能の情報を相同性に基づく系統樹の形式で収録しています。このコレクションは、UniP...
運用機関:
Princeton University, Samuel Lunenfeld Research Institute, Mount Sinai Hospital, University of Edinburgh, University of Montreal
生物種:
Arabidopsis thaliana | Bos taurus | Caenorhabditis elegans | Candida albicans | Drosophila melanogaster | ...
説明:
生物学的な相互作用のリポジトリです。タンパク質や遺伝子の相互作用、化学結合、翻訳後修飾について主要な公開文献から得られたハイスループットのデータセットと焦点を絞った個別の研究からキュレーションした生物...
運用機関:
NINDS NIH
生物種:
Homo sapiens
説明:
パーキンソン病（PD）に関連する臨床研究データのデータベースです。PD研究コミュニティ全体にわたる広いデータ共有（イメージング、臨床、遺伝的、生物特異的分析）を可能とし、PD 用バイオマーカー開発をサ...
運用機関:
Centers for Disease Control and Prevention, NINDS
生物種:
Homo sapiens
説明:
TBI (外傷性脳傷害) 関連の画像、評価、ゲノミクス、および他のデータ種類のための、拡張可能でスケーラブルな情報科学プラットフォームです。匿名化された主要なデータをTBI 研究分野全体で共有し、他の...
運用機関:
US National Institute of Mental Health (NIMH)
生物種:
Homo sapiens
説明:
自閉スペクトラム障害関連データのための拡張可能でスケーラブルな情報科学プラットフォームです。すべてのレベルの生物学的および行動的組織（分子、遺伝子、神経組織の他、行動、社会および環境相互作用）、ならび...
運用機関:
Churchill Group, The Jackson Laboratory
生物種:
Mus musculus
説明:
マウスの近交系交配を用いた様々なQTL（量的形質遺伝子座）研究から得られた生データへのアクセスを提供するアーカイブです。使用した系統、交配タイプ、個体数、表現型やQTLデータを収録しています。データは...
運用機関:
University of California San Diego
生物種:
All
説明:
膜輸送タンパク質のデータベースです。トランスポーター分類（TC: Transporter Classification）システムとして知られる、IUBMB の承認を受けた包括的な分類システムについて詳...
運用機関:
生物種:
Homo sapiens
説明:
生理学的シグナルの大規模なコレクション（PhysioBank）および関連するオープンソースソフトウェア（PhysioToolkit）への無料のオンラインアクセスを提供するサイトです。PhysioBan...
運用機関:
生物種:
All
説明:
検索可能な最大の神経科学データのコレクション、生物医学的リソースの最大のカタログ、神経科学のための最大のオントロジーを収録しています。データ、モデル、ツール、ファンドなどを対象として、抗体、細胞、疾患...
運用機関:
RUCDR Infinite Biologics, Washington University in St Louis School of Medicine
生物種:
Homo sapiens
説明:
NIDA Genetics Initiative 上で利用可能な臨床データおよび生体材料（DNA サンプルおよび細胞株）を保存し、配布するためのリソースです。リソースには、血液およびその他の生体試料の...
運用機関:
生物種:
Homo sapiens
説明:
完了した治験より得られたデータを収録するデータベースです。治験プロトコル、最初に公表した文献、データセット、アノテートした治験の報告書などを収録しています。
運用機関:
ICPSR, Institute for Social Research
生物種:
Homo sapiens | Human immunodeficiency virus
説明:
麻薬中毒やHIV研究に関連するデータを取得、保存、発信することができるツールです。広範な合法･違法薬物（アルコール、タバコ、マリファナ、コカイン、合成薬など）をカバーし、薬物使用の軌跡、パターン、なら...
運用機関:
生物種:
Homo sapiens
説明:
機能的および構造的なニューロイメージング解析のためのイメージングリソース（人気のツールの他、研究室やサイバースペースの隅に隠れている可能性のあるツールや機能を含む）のデータベースです。使用許諾レベル、...
運用機関:
ATCC Standards Development Organisation
生物種:
All | Clostridium Difficile | Enterovirus | Human metapneumovirus | Staphylococcus | ...
説明:
カテゴリーA、B、および C の優先病原体、新興感染症病原体、非病原性微生物および他の微生物学的材料に関連するコミュニティによる研究に対して、試薬、ツールおよび情報を提供するリポジトリです。
運用機関:
The UT Center for Integrative and Translational Genomics, US National Institute of Mental Health (NIMH)
生物種:
Arabidopsis thaliana | Drosophila melanogaster | Glycine max | Homo sapiens | Hordeum vulgare L. | ...
説明:
遺伝子、分子、ならびにより高次の遺伝子機能および表現型の複雑なネットワークを研究するために使用可能な、リンクされたデータセットおよびツール集です。数百人の科学者が 25 年以上かけて残したデータに、配...
運用機関:
生物種:
Canis | Homo sapiens | Mus musculus
説明:
CardioVascular Research Grid (CVRG) は、心血管に関するデータとデータ解析ツールを共有するためのサイトです。解析ツールのリストと使用例が収録されています。
運用機関:
生物種:
Homo sapiens
説明:
NHLBI の Biorepository と Data Repositoryに収録された心臓血管、肺や血液の状況に関する研究成果を一括して検索できるサイトです。サンプルのタイプ、疾患、研究手法による...
運用機関:
生物種:
説明:
選択的スプライシングを探索することができるリソースです。スプライシングの起こる位置、関係する遺伝子、スプライシングの方法を収録しています。エクソンスプライシングエンハンサー（ESE）、エクソンスプライ...
運用機関:
National Cheng Kung University (NCKU) Bioinformatics Center
生物種:
Homo sapiens
説明:
十分に特性が明らかになっているがん遺伝子およびがん抑制遺伝子の情報を収集したデータベースです。各遺伝子について、染色体上の位置、別称、タンパク質のサブユニットや機能、ドメイン、遺伝子オントロジーなどの...
運用機関:
National University of Singapore
生物種:
Homo sapiens
説明:
薬物有害反応のターゲットを容易に検索できるデータベースです。既知の薬物有害反応のターゲット、機能および特性に関する情報が含まれています。
運用機関:
生物種:
Oryza
説明:
イネの日本晴種亜種のゲノム配列と12のイネ染色体のアノテーションを提供するデータベースです。遺伝子位置、構造、予測されるタンパク質の長さなどを収録しています。これらのデータは、検索ページとアノテーショ...
運用機関:
U.S. National Library of Medicine
生物種:
All
説明:
NLM（National Library of Medicine）データベースに引用されている化学物質の同定に使用された構造および命名典拠ファイルへのアクセスを提供するオンライン検索システムです。また...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information (NCBI)
生物種:
All
説明:
米国国立衛生研究所（NIH：National Institutes of Health）が運営する、生物医学・生命科学雑誌に掲載された文献のデジタルアーカイブです。
運用機関:
National Center for Biotechnology Information (NCBI)
生物種:
Eukaryota
説明:
オルガネラについてコミュニティが標準的に使用する、キュレーションされた配列データと関連情報を提供するリソースとして、NCBI Reference Sequence（RefSeq）プロジェクトの一貫とし...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information (NCBI)
生物種:
Viruses
説明:
ウイルスのゲノム配列コレクションです。キュレーションされた配列データやコミュニティに関連する情報を提供する Entrez Genome の一貫として構築されたリソースです。ウィルスゲノムブラウザ、ウィ...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information (NCBI)
生物種:
Influenza virus
説明:
NIAID Influenza Genome Sequencing Project および GenBank から得られたデータを、インフルエンザ配列解析ツール、ならびに GenBank へのアノテーシ...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information (NCBI)
生物種:
All
説明:
GenBank に収載されたレコードに含まれる各コード配列（CDS）の分類法と各生物とレコードに正しい遺伝情報が割り当てられているかを注意深くチェックする作業の概要と参照を収録しています。変異配列、生...
運用機関:
生物種:
説明:
世界中 90 以上の集団の HLA 配列、HLA 遺伝子座、HLA 対立遺伝子座、およびハプロタイプ頻度の遺伝学的検査のサポートツールへのアクセスを提供するリソースです。この他にも、造血幹細胞移植およ...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information (NCBI)
生物種:
Arabidopsis thaliana | Caenorhabditis elegans | Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus
説明:
すべての公開 mRNA 配列（GenBank または RefSeq の mRNA、および dbEST および Trace の単一パス cDNA 配列）の包括的で非冗長な配列表示を提供するキュレーション...
運用機関:
National Center for Biological Sciences (NCBS)
生物種:
All
説明:
単一メンバータンパク質ドメインのスーパーファミリーの配列構造テンプレートを提供するデータベースです。アミノ酸配列、残基数、モチーフの３次元構造、空間的距離によるクラスタリング情報などを提供します。配列...
運用機関:
Center for Biomedical Informatics and Information Technology (CBIIT), Centers of Cancer Nanotechnology Excellence (CCNEs), Nanotechnology Characterization Laboratory (NLC), National Institute of Health
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
世界の生物医学ナノテクノロジー研究コミュニティ全体の情報共有を促進するべく設計されたデータ共有ポータルです。 生物医学においてナノテクノロジーがより迅速に利用され、その有効性が確認されることを目指して...
運用機関:
Melanoma Molecular Map Project (MMMP)
生物種:
Homo sapiens
説明:
メラノーマに焦点を当てた、がんの発症と進行に関わる分子相互作用のマップとパスウェイのコレクションです。このコレクションは３つのデータベースで構成されています：
（１）個別の患者データベース
参加医療機...
運用機関:
生物種:
All
説明:
すべてのタンパク質とゲノムに関する構造的および機能的アノテーションを収録したのデータベースです。配列、ゲノムアサインメント、構造、ドメイン組合せ、系統的分布の情報を収録しています。生物種、機能、表現形...
運用機関:
Manitoba Centre for Proteomics and Systems Biology (MCPSB)
生物種:
All
説明:
プロテオミクス実験の完全なレコードではなく、配列アサインメント検証など、特定のバイオインフォマティクス関連タスクに必要な最小限の情報を保持するデータベースです。ほとんどのデータは一連の XML ファイ...
運用機関:
Lawrence Berkeley National Laboratory (LBNL)
生物種:
All
説明:
キメラスクリーニング、標準アラインメント、および複数の公表された分類学を使用して系統学的分類を提供する16S rRNA 遺伝子データベースです。マイクロアレイ、プロトコール、シーケンス、文献、タキソノ...
運用機関:
生物種:
説明:
異なる構造予測技術によって得られた３次元タンパク質モデルを収集するデータベースです。タンパク質の配列、生物種、PDBへのリンク、予測されたモデルのデータを収録しています。
運用機関:
Krasnow Institute for Advanced Study, The National Academies of Sciences, Engineering, and Medicine
生物種:
Metazoa
説明:
デジタル形式で再構築したニューロンを公開された文献からキュレーションしたデータベースです。生物種、サンプル情報、測定条件、３次元画像を収録しています。生物種、脳の領域、細胞の種類などからの絞り込み、実...
運用機関:
Biological Sciences Research Group, Instituto Superior Técnico, Knowledge Discovery & Bioinformatics Research Group, Instituto Superior Técnico
生物種:
説明:
出芽酵母（Saccharomyces cerevisiae）の転写因子（TF）と ターゲット遺伝子との間の調節関係を収録したデータベースです。文献からキュレートしたDNA結合タンパク質のアミノ酸配列、...
運用機関:
Kansas State University
生物種:
Tribolium castaneum
説明:
コクヌストモドキ（Tribolium）の遺伝学および発生生物学のためのコミュニティリソースです。データベースは、汎用データモデル Chado 上に構築されており、ゲノム配列から突然変異表現型まで、さま...
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統合TVにて解説動画が公開されています (2017年10月04日 版）