データベースのレコード一覧 (件数: 2583)
並び替え:
生物種
カテゴリ
稼動状況
地域
その他
運用機関:
生物種:
Bos taurus | Danio rerio | Drosophila melanogaster | Homo sapiens | Mus musculus | ...
説明:
キメラ転写物とRNAシークエンシングデータのデータベースです。ヒト、マウス、ショウジョウバエ、ゼブラフィッシュ、ウシ、ラット、ブタおよび酵母におけるキメラ転写物と、ヒトがんにおける染色体切断点を収録し...
運用機関:
DataONE, National Center for Ecological Analysis and Synthesis (NCEAS)
生物種:
All
説明:
生態学および環境の研究を促進するための国際的なレポジトリです。研究の概要や生データ、メタデータを世界中のフィールドステーション、研究室、リサーチサイト、および個々の研究者から得ています。データの測定対...
運用機関:
Genetic European Variation in Disease (GEUVADIS), Principe Felipe Research Centre Computational Genomics Department (CIPF), European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), European Molecular Biology Laboratory (EMBL)
生物種:
All
説明:
すべての種のすべての遺伝的変異タイプを対象としたオープンアクセスのアーカイブです。全てのユーザーは、いずれのデータセットもダウンロードすることができ、データの登録も可能です。またVariant Bro...
運用機関:
生物種:
All
説明:
NIF (Neuroscience Information Framework) レジストリを拡張した生物医学を対象とするデータ共有、表示のためのプラットフォームです。誰でも、数百のデータソースの検索...
運用機関:
National Institutes of Health Blueprint for Neuroscience Research (NIH), Nathan S. Kline Institute for Psychiatric Research (NKI)
生物種:
Homo sapiens
説明:
世界 50 以上のサイトから収集された安静状態の脳の fMRI および DTI 画像のオープンなデータ共有のためのデータベースです。これらのコレクションには、データ利用規約を通じてオープンに利用可能な...
運用機関:
National Energy Research Scientific Computing Center (NERSC), Uppsala University
生物種:
All
説明:
世界中の科学者に、コヒーレントX線イメージング（CXI）実験のデータにアクセスする機会を提供するデータバンクです。このデータバンクは、すべての光源に対応していますが、X 線自由電子レーザー実験から生成...
運用機関:
INCF, Max Planck Institute for Human Cognitive and Brain Sciences, Stanford Digital Library, Stanford University
生物種:
Homo sapiens
説明:
人間の脳の統計的マップを収集し、配布することを目的としたデータベースです。統計的マップは、MRI や PET などの脳イメージング技術を利用して脳の機能と構造をマッピングする取り組みに基づき世界中の研...
運用機関:
生物種:
Mus musculus
説明:
Collaborative Cross (http://compgen.unc.edu/) のファウンダーマウスにおいて、インフルエンザおよびSARSによる呼吸器感染症に応答して発現する長鎖ノンコーデ...
運用機関:
Laura and John Arnold Foundation, Stanford University, National Institutes of Health (NIH)
生物種:
Homo sapiens
説明:
タスクベースの機能的磁気共鳴画像法 (task-based fMRI) の生のデータセットを提供する、オープンなデータベースです。全てのユーザーはデータの閲覧と登録が可能です。
運用機関:
University of Delhi
生物種:
Oryza sativa
説明:
イネタンパク質に関する、マニュアルキュレーションされたユニークなデータベースです。データは、公表された実験データに基づいています。現在、本データベースには、550を超える研究論文の中で報告された 2,...
運用機関:
Integrative Biomedical Informatics Group (IBI), Research Programme on Biomedical Informatics (GRIB) IMIM-UPF
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒト疾患に関与する遺伝子および変異体の最大級のコレクションを収録したプラットフォームです。専門家にキュレーションされたリポジトリ、GWASカタログ、動物モデル、および学術的文献からのデータを統合し、ヒ...
運用機関:
University of Maryland
生物種:
Bacteria
説明:
細菌ドメインにおける転写因子結合部位（TFBS）のデータベースです。カスタマイズ可能なナビゲーションおよびデータ抽出機能、コミュニティに対する意義、格納データの品質と詳細さ、情報の新しさにより、多くア...
運用機関:
Open Microscopy Environment
生物種:
All
説明:
生物分野の顕微鏡画像と付随するメタデータの閲覧、管理、解析、出版のためのオープンソースクライアント/サーバソフトウェアです。OMEROクライアントパッケージはフリーにダウンロードすることが出来ます。ユ...
運用機関:
National Centre for Biotechnolgy (CNB)
生物種:
Drosophila melanogaster | Homo sapiens
説明:
文献および他のリソースで報告されたヒトおよびショウジョウバエの中心体遺伝子のデータベースです。本データベースを利用して、中心体の進化、機能および構造を研究することができます。GeneOntology、...
運用機関:
Laboratory of Andrej Sali, University of California at San Francisco (UCSF)
生物種:
All
説明:
アノテーションが付されたタンパク質構造比較モデルのデータベースです。モデルは、MODELLERプログラム（http://salilab.org/modeller/）に基づいた、自動モデリングパイプライ...
運用機関:
CiteAB, STORM Consultancy
生物種:
All | Mus musculus | Xenopus
説明:
引用数でランク付けされた最大の抗体検索エンジンであり、有用な抗体を簡単に見つけることができます。抗体の順位を決める透明性の高い方法として、引用の数を使用しています。また、強力なフィルターにより、アプリ...
運用機関:
生物種:
説明:
解析された機能的ゲノミクス実験のためのオープンなウェブリソースです。本データベースは、注目度の高い公共のデータセットを注意深くかつ透明性高い手法で再解析し、注釈を付けることによって、完全に処理された ...
運用機関:
Michael Baudis Group, Institute of Molecular Life Sciences, SIB Swiss Institute of Bioinformatics
生物種:
Homo sapiens
説明:
arrayMapはヒトがんにおけるコピー数プロファイリングデータを対象としたリファレンスデータベースとバイオインフォマティクスリソースです。がんゲノムCNAデータのメタ解析とシステムレベルでのデータ統...
運用機関:
Michael Baudis Group, Institute of Molecular Life Sciences
生物種:
Homo sapiens
説明:
比較ゲノムハイブリダイゼーション（CGH）実験や全ゲノム・全エクソームシーケンス（WGS、WES）研究から得られた、ヒトがんにおけるコピー数異常の概要を提供するデータベースです。がんプロファイルデータ...
運用機関:
生物種:
説明:
ロックフェラー大学出版の査読済ジャーナルである The Journal of Cell Biology に掲載された論文と関連したオリジナルの顕微鏡画像データセットの画像をホストし、可視化するプラット...
運用機関:
University of Porto
生物種:
Caenorhabditis elegans | Drosophila melanogaster | Homo sapiens | Macaca mulatta | Mus musculus | ...
説明:
ミトコンドリアDNA（mtDNA）再編成に関するキュレーションされたデータセットを含む包括的なオンラインリソースです。7つの生物種における、環状欠失・環状重複・線状各タイプのmtDNA再編成ブレイクポ...
運用機関:
University of Missouri
生物種:
Glycine max
説明:
大豆翻訳ゲノミクスと分子育種のためのウェブリソースです。遺伝子/タンパク質、miRNA / sRNA、代謝産物、SNP、植物導入（PI系）および形質に関する情報を収録しています。大豆ゲノミクスおよびマ...
運用機関:
European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)
生物種:
All | Anopheles gambiae | Arabidopsis thaliana | Bos indicus | Bos taurus | ...
説明:
自由に利用可能なメタゲノムデータの保存、解析、比較のためのプラットフォームです。微生物の系統的多様性の他、サンプルの機能的および代謝的ポテンシャルについての知見を提供することを目的としています。プロジ...
運用機関:
European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), Institute for Systems Biology (ISB), University of California San Diego, National Center for Protein Sciences, University of Washington
生物種:
All
説明:
ProteomeXchange は、PRIDEやPeptideAtlasなどの主なプロテオミクスリポジトリへのMS プロテオミクスデータ登録とデータ配布の標準化のためのコンソーシアムです。データ登録に...
運用機関:
GigaScience/BGI HK Ltd
生物種:
All
説明:
GigaScience ジャーナルの論文に関連するデータとツールを提供するリポジトリです。ただし、GigaScience の論文に関連付けられていないデータも一部含まれています。シークエンスデータ、解...
運用機関:
Yale University School of Medicine
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
脊椎動物の嗅覚受容体（OR: olfactory receptor）遺伝子およびタンパク質のデータベースです。味覚受容体、鋤鼻器官受容体、昆虫や線虫の嗅覚受容体、菌類のフェロモン受容体の情報も含まれて...
運用機関:
Washington University in St Louis School of Medicine
生物種:
Saccharomyces cerevisiae
説明:
出芽酵母（Saccharomyces cerevisiae）の転写因子に対する位置特異的重み行列（PWM：position weight matrices）のデータベースです。各転写因子に対して、in...
運用機関:
Department of Molecular Biology, The Scripps Research Institute, Washington State University
生物種:
Saccharomyces cerevisiae
説明:
出芽酵母の実験データを格納するデータベースです。質量分析、ツーハイブリット、蛍光顕微鏡、タンパク質構造予測のデータが含まれます。遺伝子・タンパク質名、SwissProt ID、GO term、実験手法...
運用機関:
Washington State University
生物種:
Fragaria vesca | Malus domestica | Malus x domestica | Prunus mume | Prunus persica | ...
説明:
キュレーションおよび統合された、バラ科（Rosaceae）のオンラインデータベースです。ゲノミクス、遺伝学、育種に関するデータ、および解析ツールを提供します。ゲノム配列、トランスクリプトーム、遺伝子マ...
運用機関:
US Department of Health and Human Services, VectorBase
生物種:
Aedes aegypti | Anopheles gambiae | Chelicerata | Culicidae | Diptera | ...
説明:
ヒトの病原体を媒介する無脊椎動物に関する情報を集約したデータリポジトリです。媒介生物ゲノムに注釈を付け、メンテナンスすることで、研究コミュニティに統合されたリソースを提供します。マラリアを引き起こすマ...
運用機関:
University of Wisconsin-Madison
生物種:
All
説明:
ゲノム配列データおよび遺伝子発現データを保存、更新、および配布するために開発された、関係データベースおよびウェブインターフェースです。コミュニィの研究者らが、ゲノムに対し、容易かつ継続的にアノテーショ...
運用機関:
Jurisica Lab, Ontario Cancer Institute
生物種:
Caenorhabditis elegans | Drosophila melanogaster | Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus
説明:
ヒトとモデル生物の、実験的に既知もしくは予測されたタンパク質-タンパク質相互作用のデータベースです。タンパク質名、SwissProt ID、生物種などを指定して相互作用データを検索でき、全データのダウ...
運用機関:
University of Toronto
生物種:
Escherichia coli
説明:
大腸菌に関する知識ベースとして、タンパク質 - タンパク質間の物理的相互作用と機能的相互作用を統合したデータベースです。タンパク質名、ドメイン名、GO termなどでの相互作用データの検索、Blast...
運用機関:
University of Tartu
生物種:
Eukaryota | Fungi
説明:
真菌類の種同定を目的としたrDNAのITS (internal transcribed spacer) 配列のデータベースです。ITS配列を基にした菌類の分類群をspecies hypotheses ...
運用機関:
United Kingdom National Crystallography Service (NCS), University of Southampton
生物種:
説明:
サウサンプトン化学結晶学グループ（Southampton Chemical Crystallography Group） と 英国 EPSRC 国家結晶学サービス（National Crystallo...
運用機関:
University of Nebraska Medical Center
生物種:
All
説明:
抗菌ペプチド（AMP）のデータベースです。天然由来の、アミノ酸配列が同定されており、活性が確認されている、100アミノ酸残基未満の抗菌ペプチドについてのデータが収録されています。データは文献からマニュ...
運用機関:
University of Leiden
生物種:
Anopheles gambiae | Bacillus subtilis | Bombyx mori | Bordetella pertussis | Bos taurus | ...
説明:
2次構造、機能および配列データを含むRNAシュードノットのデータベースです。クラスまたは属性値によって、データの閲覧が可能です。また、ユーザーがシュードノットデータを登録することも可能です。
運用機関:
University of Helsinki
生物種:
Homo sapiens
説明:
腫瘍サンプルの臨床情報とマイクロアレイデータのデータベースです。アレイ比較ゲノムハイブリダイゼーション（aCGH）および遺伝子コピー数変化のデータマイニングに重点を置いています。キーワードによるマイク...
運用機関:
Georgetown University, Protein Information Resource Consortium, University of Delaware
生物種:
All
説明:
アミノ末端、カルボキシル末端およびペプチド鎖のクロスリンク翻訳後修飾を含むタンパク質修飾のためのアノテーションおよび構造の包括的なコレクションです。名前、文献情報、GO IDや分子量などを組み合わせた...
運用機関:
University of Cologne
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
ヒトおよびマウスにおける免疫グロブリン遺伝子座に由来する生殖細胞系列可変領域（V）遺伝子の統合データベースです。全てのV遺伝子配列は EMBLおよびEnsemblデータベースから抽出されたものです。I...
運用機関:
University of California-Santa Barbara
生物種:
Metazoa | Viridiplantae
説明:
研究者および一般利用者に、古生物学に関する情報を提供するデータベースです。PBDB Navigatorツールにより、年代・場所・生物分類で化石の産状を絞り込んで表示することが出来ます。また、必要な情報...
運用機関:
University of California Los Angeles
生物種:
Mus musculus
説明:
ノックアウト変異マウスの系統データベースです。KOMP、EUCOMMなどのプロジェクトにより作成されたノックアウトマウスの系統について、ベクター、変異EC細胞、野生種EC細胞、成体などの別や、ES細胞...
運用機関:
Institute for Genomics and Bioinformatics, University of California, Irvine, University of California Los Angeles
生物種:
説明:
システム生物学における合成ビルディングブロック、プローブとして、そして薬物および他の有用な化合物の発見のためのリード化合物として使用する上で重要な、約 500 万の商業的に入手可能な低分子を含む化学物...
運用機関:
Cincinnati Children's Hospital Medical Center, University of Calgary
生物種:
Xenopus | Xenopus laevis | Xenopus tropicalis
説明:
アフリカツメガエル（Xenopus laevis）と ネッタイツメガエル （X. tropicalis） の包括的なモデル生物データベースです。ゲノム、遺伝子発現データ、遺伝子情報、解剖学と発生学情報...
運用機関:
Wishart Lab, University of Alberta
生物種:
All
説明:
詳細な毒素データと包括的な毒素標的情報を組み合わせたバイオインフォマティクスリソースです。カテゴリーからのブラウジングの他、テキスト、構造やMSデータなどによる検索が可能です。
運用機関:
University College London
生物種:
All
説明:
タンパク質ドメイン構造の階層的な分類を収録したデータベースです。Protein Data Bankから得られたタンパク質構造は、自動および手作業で CATH階層： Class (C)、Architec...
運用機関:
Universite de Geneve
生物種:
Bacteria | Eukaryota | Vertebrata
説明:
真核生物のオーソロガスなタンパク質コード遺伝子のカタログを提供するリソースです。タンパク質コード遺伝子を最後の共通祖先（the last common ancestor ：LCA ）に従って分類し、種...
運用機関:
University of Maryland
生物種:
Homo sapiens
説明:
各疾患変異を遺伝子、タンパク質、またはドメイン位置によって表示するデータベースです。ヒトの全てのコーディング遺伝子の変異をタンパク質ドメインにマッピングし、関連する機能情報（結合部位ドメインの活性、触...
運用機関:
Trinity College Dublin
生物種:
All
説明:
IUBMB 酵素学名リストのデータにアクセスするための新たなツールとして開発されたデータベースです。MySQL データベースに格納されているデータは、IUPAC 標準に従い化学名のフォーマットを保存し...
本カタログの使い方
統合TVにて解説動画が公開されています (2017年10月04日 版）