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IID: Integrated Interactions Database

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02677
名称データベースの名称 IID
別称データベースの別称 Integrated Interactions Database
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://iid.ophid.utoronto.ca/
運用機関名現在データベースを運用している機関名 The International Molecular Exchange Consortium
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 カナダ
説明データベースの説明 タンパク質-タンパク質相互作用(protein-protein interactions;PPI)のデータベースです。ヒト、モデル生物、および家畜などの身近な動物を対象として、実験的に既知もしくは予測されたPPIに関わるタンパク質名、生物種、局在範囲、薬剤ターゲットの可能性などをキュレートされたデータベースから収集しています。遺伝子名、UniProt ID、Entrez Gene ID 、生物種などを指定して相互作用データを検索できます。またネットワークが可視化できます。全データのダウンロードが可能です。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Homo sapiens (9606), Drosophila melanogaster (7227), Mus musculus (10090), Rattus norvegicus (10116), Caenorhabditis elegans (6239), Saccharomyces cerevisiae (4932), Vicugna pacos (30538), Gallus gallus (9031), Felis catus (9685), Bos taurus (9913), Canis familiaris (9615), Anas platyrhynchos (8839), Cavia porcellus (10141), Equus caballus (9796), Sus scrofa (9823), Oryctolagus cuniculus (9986), Ovis aries (9940), Meleagris gallopavo (9103)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:34755877
DOI:10.1093/nar/gkab1034
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク https://iid.ophid.utoronto.ca/#download_tab
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件
データベースの使い方 https://iid.ophid.utoronto.ca/#help_tab
データベースの連絡先 https://iid.ophid.utoronto.ca/#about_tab
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク https://doi.org/10.25504/FAIRsharing.536d54
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 See the corresponding part in the FAIRsharing record
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日
本レコードの利用条件 Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license