レコード詳細

Thumbnail

CKB: Cancer Knowledgebase

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02672
名称データベースの名称 CKB
別称データベースの別称 Cancer Knowledgebase
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://www.genomenon.com/somatic-curation
運用機関名現在データベースを運用している機関名 GENOMENON
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 アメリカ合衆国
説明データベースの説明 腫瘍に関するゲノムプロファイルのデータベースです。遺伝子/変異体のアノテーション、治療に関する知見、診断/予後情報、臨床試験に関するデータを収録しています。遺伝子の名称、シノニム、NCBI gene ID、バリアントID、変異のタンパク質への影響の他、エビデンスによるアノテーションにより変異をターゲットとなる治療法と結びつけます。さらに、臨床試験を受けた患者の遺伝子型に特異的なゲノム変化を含む適格基準を収載しています。アクセスフリーのCKB COREには50の遺伝子に関する情報が含まれており、遺伝子、変異による検索が可能です。また遺伝子リストからの検索も可能です。利用者登録が必要です。JAX-CKB (https://catalog.integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc02156)の後継サイトです。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Homo sapiens (9606)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:26772741
DOI:10.1186/s40246-016-0061-7
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 https://ckbhome.genomenon.com/about/index
データベースの使い方 https://www.genomenon.com/somatic-curation https://ckb.genomenon.com/about/tutorial
データベースの連絡先 https://ckbhome.genomenon.com/about/contact
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2026-02-17
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license