レコード詳細
EnteroBase
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC02630 |
|---|---|
| 名称データベースの名称 | EnteroBase |
| 別称データベースの別称 | ― |
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | https://enterobase.warwick.ac.uk/ |
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | Warwick Medical School, University of Warwick |
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | イギリス |
| 説明データベースの説明 | 腸内細菌のゲノムデータベースです。サルモネラ菌、大腸菌、赤痢菌、マイコバクテリウム、ビブリオ属、エルシニア属、ヘリコバクター、モラクセラの各strainごとにメタデータ、ゲノム配列、推定されたジェノタイピングデータを収録しています。属内の変異を定量化、可視化するツールも備えています。 |
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Salmonella (590), Escherichia (561), Shigella (620), Mycobacterium (1763), Vibrio (662), Yersinia (629), (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=), Moraxella (475) |
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
|
| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
|
| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI | ― |
| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 |
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― |
| データベースの使い方 | https://enterobase.readthedocs.io/en/latest/index.html# |
| データベースの連絡先 | https://enterobase.readthedocs.io/en/latest/enterobase-terms-of-use.html#who-we-are-and-how-to-contact-us |
| API / SPARQL endpoint | ― |
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― |
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― |
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― |
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | ― |
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog |
| レコードの由来レコードの由来 |
|
| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2024-03-22 |
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2024-03-22 |
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |