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ABCD database: AntiBodies Chemically Defined database

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02622
名称データベースの名称 ABCD database
別称データベースの別称 AntiBodies Chemically Defined database
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://web.expasy.org/abcd/
運用機関名現在データベースを運用している機関名 Geneva Antibody Facility, University of Geneva
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 スイス
説明データベースの説明 配列を決定した抗体(主に組換え抗体) のデータベースです。文献や特許、タンパク質構造データ、大規模なファージディスプレイ法やハイブリドーマ配列解析プロジェクトの論文やリポジトリから、マニュアルキュレーションによってデータを収集しています。タンパク質と化合物のどちらを抗原とするタイプの抗体も扱っており、シーケンシングされた抗体の名称、使用実験のタイプ、ターゲットの種類や外部DBへのリンク、エピトープなどを含む包括的なリストを提供します。抗体にはそれぞれunique IDを割り当てています。 抗体の名前でも検索できますがシノニムに完全には対応できていないので、ターゲット名/UniProtKB ID/ChEBI ID/種名で検索することを推奨しています。 研究者による組換え抗体の広範な使用を促進し、最終的には動物が産生する抗体からの代替を促すことを目的としています。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID All (1)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:31410491
DOI:10.1093/nar/gkz714
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 https://www.expasy.org/terms-of-use
データベースの使い方
データベースの連絡先 https://web.expasy.org/contact
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク https://fairsharing.org/FAIRsharing.Z8OKi5
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レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2022-05-11
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2022-05-11
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license