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系譜情報データベース： Pedigree Finder

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02592
名称データベースの名称 系譜情報データベース： Pedigree Finder
別称データベースの別称 ―
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://pedigree.db.naro.go.jp/
運用機関名現在データベースを運用している機関名 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 基盤技術研究本部 農業情報研究センター (J-Globalへのリンク)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 日本
説明データベースの説明 作物の系譜情報を収録したデータベースです。アズキ、イチゴ、イネ、クリ、サツマイモ、ニホンナシ、リンゴについて、系譜情報を交雑育種（母系、父系)やその他の育種方法で色分けし、名称、品種や地方系統などのタイプとともにグラフィカルに表示します。系統名を入力し、作物種を選択して、系統を絞り込みます。表示する祖先および子孫の世代数や、データセットから得られる形質・遺伝子型情報による色分けが変更でき、系譜は画像として保存も可能です。また、近縁係数計算プログラムも利用できます。 非制限公開データと制限公開データとが含まれており、DBの利用にはユーザー登録によるログインが必要です。ユーザー登録など詳細については以下に記載があります（https://ml-wiki.sys.affrc.go.jp/pedigree/）。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Vigna angularis (3914), Fragaria x ananassa (3747), Oryza sativa (4530), Castanea crenata (103480), (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=), Ipomoea batatas (4120), Malus domestica (3750)
タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI ―
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 日本語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク ―
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 ―
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 https://ml-wiki.sys.affrc.go.jp/pedigree/termsofuse
データベースの使い方 https://pedigree.db.naro.go.jp/tutorial
データベースの連絡先 https://prd.form.naro.go.jp/form/pub/naro01/pedigree_contact
API / SPARQL endpoint ―
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク ―
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク ―
統合TVへのリンク統合TVへのリンク ―
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク ―
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2021-10-27
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2021-10-27
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license