レコード詳細

Thumbnail

OGRDB: Open Germline Receptor Database

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02580
名称データベースの名称 OGRDB
別称データベースの別称 Open Germline Receptor Database
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://ogrdb.airr-community.org
運用機関名現在データベースを運用している機関名 Institute of Structural and Molecular Biology, Birkbeck College
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 イギリス
説明データベースの説明 ヒトの生殖細胞系列変異のデータベースです。世界の研究者から提出された配列データを国際がん研究機関(IARC)が検証し、信頼性が認められた変異について、IMGTの定めた配列名、全体の配列、コーディング領域の配列、機能性の有無、IARCによる検証履歴などが収録されており、IMGT(the international ImMunoGeneTics information system)へのリンクから、変異のレパートリーを確認できます。また、収録データは一括ダウンロードが可能です。検証履歴を見ることで、各データの信頼性の根拠がすぐにわかることが特徴です。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Homo sapiens (9606)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:31566225
DOI:10.1093/nar/gkz822
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク https://ogrdb.airr-community.org/sequences
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 https://ogrdb.airr-community.org/render_page/licensing_statement.html
データベースの使い方
データベースの連絡先 https://ogrdb.airr-community.org/
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2021-08-24
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2022-05-29
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license