レコード詳細

Thumbnail

J-amir: Japanese aquatic macroinvertebrate reference

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02574
名称データベースの名称 J-amir
別称データベースの別称 Japanese aquatic macroinvertebrate reference
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://www.b.s.osakafu-u.ac.jp/~mkato/J-amir_home.htm
運用機関名現在データベースを運用している機関名 大阪府立大学 (J-Globalへのリンク)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 日本
説明データベースの説明 日本産水生生物類デジタルデータ集です。大阪府立大学 河川メタゲノム研究グループが採集・収集した日本産水生生物類の生体試料について個体全体および種判別に特徴的な形態部分の写真と種判別マーカーとなるDNA情報を収録しています。種判別マーカーとしては、18S rRNA、ヒストンH3、ミトコンドリアCOI の遺伝子部分配列を解析しています。生物目、科でまとめたリストからの絞り込みが可能です。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Ephemeroptera (30073), Odonata (6961), Plecoptera (50622), Hemiptera (7524), Megaloptera (50553), Trichoptera (30263), Coleoptera (7041), Diptera (7147), Amphipoda (6821), Isopoda (29979), Decapoda (6683), Acari (6933), Cyclopoida (84308), Mantodea (7504), Orthoptera (6993)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:-
DOI:10.1515/dna-2016-0001
PubMed ID:-
DOI:10.1016/j.egg.2020.100065
PubMed ID:32995390
DOI:10.1016/j.dib.2020.106284
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 日本語, 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件
データベースの使い方
データベースの連絡先 http://www.b.s.osakafu-u.ac.jp/~mkato/J-amir_home.htm
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2021-07-29
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2021-07-29
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license