レコード詳細
LRG: Locus Reference Genomic
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC02566 | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| 名称データベースの名称 | LRG | ||||
| 別称データベースの別称 | Locus Reference Genomic | ||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://www.lrg-sequence.org/ | ||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), National Center for Biotechnology Information (NCBI) | ||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | イギリス, アメリカ合衆国 | ||||
| 説明データベースの説明 | ゲノム、転写産物、タンパク質のリファレンス配列のデータベースです。臨床に関連する変異配列を報告するためのリファレンス配列を、 NCBI（RefSeq）とEMBL-EBI（Ensembl / GENCODE）の協力により情報統合しています。 各レコードには、ゲノム、転写産物、タンパク質の配列、アノテーション、ゲノムアセンブリに関するマップなどが含まれています。LRG番号、HGNC遺伝子名、NCBIやEnsemblのID番号（遺伝子、転写産物）、遺伝子の同義語、公開非公開の別による絞り込みが可能です。また、Ensembl、NCBI、UCSCのゲノムブラウザが利用可能です。 | ||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Homo sapiens (9606) | ||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
|
||||
| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
|
||||
| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
|
||||
| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 | ||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | http://www.lrg-sequence.org/data/ | ||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | http://www.lrg-sequence.org/data/ | ||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | http://www.lrg-sequence.org/documentation/further_information/ | ||||
| データベースの使い方 | http://www.lrg-sequence.org/documentation/training/ | ||||
| データベースの連絡先 | http://www.lrg-sequence.org/contact/ | ||||
| API / SPARQL endpoint | http://www.lrg-sequence.org/web-service/ | ||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | ― | ||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog | ||||
| レコードの由来レコードの由来 |
|
||||
| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2021-03-17 | ||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2021-03-17 | ||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |