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DGiDB: Drug Gene Interaction database

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02562
名称データベースの名称 DGiDB
別称データベースの別称 Drug Gene Interaction database
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://www.dgidb.org/
運用機関名現在データベースを運用している機関名 McDonnell Genome Institute, Washington University School of Medicine
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 アメリカ合衆国
説明データベースの説明 DGIdbは薬物と遺伝子の相互作用および創薬可能なゲノム資源に関するデータベースです。 DrugBank、PharmGKB、Chembl、Drug Target Commons、TTDなど、様々な論文、データベース、その他のWebリソースから、薬物と遺伝子の相互作用および遺伝子の創薬への適用可能性情報を専門家によるキュレーションとテキストマイニングにより整理・統合して提供しています。 薬に関するレコード、遺伝子に関するレコード、相互作用に関するレコードに分かれて整理されており、相互に参照できます。すべてのデータは、無料でダウンロードするか(*ダウンロードページに条件が記載されている場合を除く)、APIを介してアクセスできます。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Homo sapiens (9606)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:33237278
DOI:10.1093/nar/gkaa1084
PubMed ID:29156001
DOI:10.1093/nar/gkx1143
PubMed ID:26531824
DOI:10.1093/nar/gkv1165
PubMed ID:24122041
DOI:10.1038/nmeth.2689
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク https://www.dgidb.org/downloads
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 https://github.com/dgidb/dgidb/blob/master/LICENSE
データベースの使い方
データベースの連絡先 https://www.dgidb.org/contact
API / SPARQL endpoint https://www.dgidb.org/api
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2021-03-10
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2021-03-10
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license