レコード詳細
Omics Discovery Index: OmicsDI
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC02291 | ||||
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| 名称データベースの名称 | Omics Discovery Index | ||||
| 別称データベースの別称 | OmicsDI | ||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://www.omicsdi.org/home | ||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | European Molecular Biology Laboratory (EMBL), National Center for Protein Sciences | ||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | 中国, European Union, イギリス | ||||
| 説明データベースの説明 | 複数のレポジトリからのオミックスデータ（トランスクリプトミクス、ゲノミクス、プロテオミクス、メタボロミクス）を統合し、検索を可能にしたリソースです。ArrayExpress、PRIDE、MassIVE、EGAなどからのメタデータと生物実体のデータをOmicsDI XML形式に変換し、PubMed、ChEBI、UniProtなどを用いてアノテーションと索引付けをすることで統合されたデータを検索することが可能です。類似のデータセットを計算して表示する機能もあります。また、APIが用意されており、プログラムからの利用も可能です。 | ||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | All (1) | ||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 | ||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― | ||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― | ||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||
| データベースの使い方 | ― | ||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | http://togotv.dbcls.jp/ja/20180704.html | ||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.re1278 | ||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||
| レコード管理者レコード管理者 | See the corresponding part in the FAIRsharing record | ||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2019-03-28 | ||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2020-07-09 | ||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |