レコード詳細
運用終了
CRISPRdb
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC02213 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 名称データベースの名称 | CRISPRdb | ||||||||||||
| 別称データベースの別称 | ― | ||||||||||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://crispr.i2bc.paris-saclay.fr/ | ||||||||||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | Universitè Paris-Sud 11, CNRS | ||||||||||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | フランス | ||||||||||||
| 説明データベースの説明 | 公開された微生物ゲノムやユーザーが提供する配列に対して、CRISPR 配列を容易に検出するためのデータベースとツールを提供するサイトです。また、CRISPR-cas （CRISPR-associated sequsence）遺伝子にアノテーションが付いている場合には、cas の存在に関する情報も提供します。 各CRISPRレコードには種名、塩基配列、開始位置、スペーサー数などを収録しています。 オリジナルサイトの運用は終了し、後継サイトCRISPRCasdb（https://crisprcas.i2bc.paris-saclay.fr/ ）に引き継がれています。 | ||||||||||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Archaea (2157), Bacteria (2) | ||||||||||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
|
||||||||||||
| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
|
||||||||||||
| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
|
||||||||||||
| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||||||||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 運用終了 | ||||||||||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― | ||||||||||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― | ||||||||||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||||||||||
| データベースの使い方 | ― | ||||||||||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||||||||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||||||||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||||||||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||||||||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||||||||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.7sfedh | ||||||||||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||||||||||
| レコード管理者レコード管理者 | See the corresponding part in the FAIRsharing record | ||||||||||||
| レコードの由来レコードの由来 |
|
||||||||||||
| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2019-03-28 | ||||||||||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2024-05-15 | ||||||||||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |