NBDC02188 - Integbio データベースカタログ

レコード詳細

mirDNMR

NBDC02188

名称

mirDNMR

別称

―

URL

http://www.wzgenomics.cn/mirdnmr/

運用機関名

Wenzhou Medical University

運用機関所在国・地域

中国

説明

遺伝子中心のバックグラウンド新生突然変異率（DNMR ： novo mutation rate）のデータベースです。異なる方法および集団の変動データから得られたバックグラウンドDNMRや各遺伝子のヒト遺伝子変異データベースにおける変異アレル頻度を収録しています。データベースには次の機能があります。(i) 次の 4 つの方法によって予測された各遺伝子のバックグラウンドDNMRをブラウズし、検索する：GC コンテンツ（DNMR-GC）、配列コンテキスト（DNMR-SC）、遺伝子の長さ、変異タイプ、生物学的進化などの複数因子（DNMR-MF）および局所的 DNA メチル化レベル（DNMR-DM）、（ii）ExAC、ESP6500、UK10K、1000G、 dbSNP などの公開されているデータベースの変異頻度を検索する、（iii）3つの統計的方法（TADA、二項検定、ポアソン検定）を用いて、4 種のバックグラウンド DNMR に基づいて候補遺伝子に優先順位を付けるための DNM 負荷を調べる、（iv）バックグラウンドDNMRに基づく遺伝子リストのフィルタリング、およびヒトの遺伝子変異データベースにおける様々なタイプの変異体の分布、（v）知的障害および制御のための背景遺伝子ベースのDNMR（DNMR-GC、DNMR-SC、DNMR-MF、DNMR-DM、DNMR-平均）およびトリマーベースのWES / WGSからの制御をダウンロードします。

生物種

Homo sapiens (9606)

タグ（対象）