レコード詳細
休止
CUBE-DB
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC02094 | ||||||||
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| 名称データベースの名称 | CUBE-DB | ||||||||
| 別称データベースの別称 | ― | ||||||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://epsf.bmad.bii.a-star.edu.sg/cube/db/html/home.html | ||||||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | Evolution of Protein Structure and Function Group, Biomolecular Modelling and Design Division, Bioinformatics Institute | ||||||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | シンガポール | ||||||||
| 説明データベースの説明 | ヒトのタンパク質ファミリーにおける機能的分岐を検出するためのデータベースです。ヒトタンパク質のマルチメンバーファミリーに属するパラログタンパク質中の残基について、事前評価した保存スコアおよび専門化スコアを収録しています。タンパク質ファミリーの分類は、HUGO Gene Nomenclature Committee によって提案された分類に（ほぼ）従っています。オーソロガスなタンパク質配列のセットは、Ensembl から入手可能な完全脊椎動物ゲノムを用いて、 mutual-best-hit 戦略により生成されました。ドキュメントページに記述されているスコアは、個々のタンパク質の残基に割り当てられ、表形式（html またはダウンロード可能な xls 形式）で表示されると同時に、適切な場合には、関連する構造（Jmol、Pymol、Chimera）にマッピングされます。 | ||||||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Vertebrata (7742) | ||||||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 休止 | ||||||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― | ||||||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― | ||||||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||||||
| データベースの使い方 | ― | ||||||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.aqb4ne | ||||||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||||||
| レコード管理者レコード管理者 | See the corresponding part in the FAIRsharing record | ||||||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2019-03-28 | ||||||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2019-06-17 | ||||||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |