レコード詳細

Automatic molecular interaction predictions: InteroPorc
IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC01741 | ||||
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名称データベースの名称 | Automatic molecular interaction predictions | ||||
別称データベースの別称 | InteroPorc | ||||
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://biodev.extra.cea.fr/interoporc/ | ||||
運用機関名現在データベースを運用している機関名 | LBI Team (CEA) | ||||
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | フランス | ||||
説明データベースの説明 | タンパク質 - タンパク質相互作用ネットワークを推測する自動予測ツールです。interolog 概念に基づいたメソッドを採用しており、ソースである公共データベースから得られた相互作用のデータセットと、Integr8 上で入手可能なオーソロガスなタンパク質(PORC)のクラスターとを組み合わせています。 | ||||
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Arabidopsis thaliana (3702), Drosophila melanogaster (7227), Escherichia coli (562), Helicobacter pylori (210), Homo sapiens (9606), Mus musculus (10090), Rattus norvegicus (10116) | ||||
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||
稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 | ||||
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― | ||||
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― | ||||
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||
データベースの使い方 | ― | ||||
データベースの連絡先 | ― | ||||
API / SPARQL endpoint | ― | ||||
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||
統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.3hrbfr | ||||
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||
レコード管理者レコード管理者 | See the corresponding part in the FAIRsharing record | ||||
レコードの由来レコードの由来 |
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レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2019-03-28 | ||||
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2020-07-09 | ||||
本レコードの利用条件 | Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |