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ForestGEN: Forest EST and Genome database

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC01292
名称データベースの名称 ForestGEN
別称データベースの別称 Forest EST and Genome database
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://forestgen.ffpri.go.jp/jp/index.html
運用機関名現在データベースを運用している機関名 国立研究開発法人森林研究・整備機構 森林総合研究所 (J-Globalへのリンク)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 日本
説明データベースの説明 森林に生息する生物のゲノム情報を提供しているデータベースです。スギ、ヒノキなど森林を構成する樹木、菌類や線虫などの微生物、きのこ、その他の森林性生物のゲノム情報を研究者に無償で提供し、森林におけるゲノミクス、集団遺伝、病理、育種研究の発展に貢献することを目的としています。これらの研究成果を森林が持つ有益な機能を最大限に発揮する森林の取り扱い手法の開発や、未知なる遺伝子資源の宝庫である森林からの新たな有用遺伝子の発見につなげる狙いがあります。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Bursaphelenchus xylophilus (6326), Bursaphelenchus mucronatus (6325), Cryptomeria japonica (3369), Chamaecyparis obtusa (13415), Populus nigra var. italica (1954247), Lentinula edodes (5353), Tricholoma matsutake (40145)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 日本語, 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 https://forestgen.ffpri.go.jp/jp/overview.html
データベースの使い方 https://forestgen.ffpri.go.jp/jp/help.html
データベースの連絡先 https://forestgen.ffpri.go.jp/jp/contactus.html
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2013-07-01
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2021-01-26
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license