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レコード詳細

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UCSC Xena

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC01238
名称データベースの名称 UCSC Xena
別称データベースの別称 ―
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://xena.ucsc.edu
運用機関名現在データベースを運用している機関名 University of California, Santa Cruz
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 アメリカ合衆国
説明データベースの説明 遺伝子と疾患とを関連づけるゲノミクスデータベースです。癌や腫瘍の種類ごとに分類されたデータセットについて、コピー数多型（CNV）、DNAメチレーション、遺伝子やエクソンの発現、タンパク質発現、miRNA発現、位置変異、形質アノテーションの情報を収録しています。サンプル毎の遺伝子の発現状況をヒートマップ状に表示し、目的のサンプルをクリックすることでUCSC Genome Browser on Human へ移動できます。UCSC Cancer Browser に新しい機能を追加した後継サイトです。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Homo sapiens (9606)
タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:21059681
DOI:10.1093/nar/gkq1113
PubMed ID:20529912
DOI:10.1093/bioinformatics/btq182
PubMed ID:23109555
DOI:10.1093/nar/gks1008
PubMed ID:-
DOI:10.1101/326470
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク ―
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 ―
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 ―
データベースの使い方 ―
データベースの連絡先 ―
API / SPARQL endpoint ―
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク ―
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク ―
統合TVへのリンク統合TVへのリンク ―
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク ―
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2012-12-25
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2019-05-12
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license